40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1513 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  597  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  83.45 
 
 
302 aa  508  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  61.17 
 
 
289 aa  344  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  57.48 
 
 
304 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  42.33 
 
 
575 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  30.22 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1213  hypothetical protein  33.33 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5122  hypothetical protein  37.31 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0730862  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  33.12 
 
 
274 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  30.59 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3834  membrane protein-like protein  31.1 
 
 
239 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  29.37 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4948  hypothetical protein  34.16 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000111229  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3291  protein of unknown function DUF422  28.71 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0102  membrane protein-like protein  34.27 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  33.56 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2309  hypothetical protein  38.46 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3246  hypothetical protein  35.34 
 
 
279 aa  65.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927983  normal  0.115711 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1489  protein of unknown function DUF422  35.48 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3945  hypothetical protein  30 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.230705 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1970  hypothetical protein  29.57 
 
 
280 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.715339  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0383  hypothetical protein  33.12 
 
 
344 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.641319  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3473  hypothetical protein  31.98 
 
 
280 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0783282  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1003  carotene biosynthesis associated membrane protein  31.88 
 
 
311 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1394  hypothetical protein  34.46 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326287  hitchhiker  0.000408196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3223  protein of unknown function DUF422  31.35 
 
 
260 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00453975  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3702  membrane protein-like protein  29.88 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3411  hypothetical protein  28.7 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0360  hypothetical protein  28.14 
 
 
281 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.970781  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2204  membrane protein-like protein  36.64 
 
 
254 aa  55.8  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.537082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1509  hypothetical protein  31.55 
 
 
296 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454469 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1362  carotene biosynthesis associated membrane protein  32.09 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1898  hypothetical protein  27.63 
 
 
290 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2732  hypothetical protein  30.36 
 
 
296 aa  53.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0866  hypothetical protein  26.8 
 
 
306 aa  53.1  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4078  membrane protein-like protein  33.33 
 
 
498 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1899  carotene biosynthesis associated membrane protein  32.03 
 
 
293 aa  47  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1273  hypothetical protein  28.48 
 
 
289 aa  46.2  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.917588  hitchhiker  0.0000000103093 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0115  hypothetical protein  31.06 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2375  carotene biosynthesis associated membrane protein  28.85 
 
 
294 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0121546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>