32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0115 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0115  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2204  membrane protein-like protein  43.54 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.537082  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1362  carotene biosynthesis associated membrane protein  39.23 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  31.47 
 
 		 302 aa  75.5  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1003  carotene biosynthesis associated membrane protein  37.82 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  30.19 
 
 		 302 aa  72  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  32.08 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  34.88 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1899  carotene biosynthesis associated membrane protein  38.39 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  37.01 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2375  carotene biosynthesis associated membrane protein  32.87 
 
 		 294 aa  62  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0121546  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  38.02 
 
 		 575 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  30.17 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3834  membrane protein-like protein  38.85 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  32.86 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  31.11 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2702  carotene biosynthesis associated membrane protein  41.96 
 
 		 308 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  36.59 
 
 		 274 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5122  hypothetical protein  34.96 
 
 		 277 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0730862  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0360  hypothetical protein  25.68 
 
 		 281 aa  52  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.970781  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1213  hypothetical protein  32.71 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3291  protein of unknown function DUF422  35.96 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1394  hypothetical protein  38.98 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326287  hitchhiker  0.000408196 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3945  hypothetical protein  32.82 
 
 		 291 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.230705 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1970  hypothetical protein  32.03 
 
 		 280 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3246  hypothetical protein  31.54 
 
 		 279 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927983  normal  0.115711 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0102  membrane protein-like protein  33.81 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4948  hypothetical protein  34.19 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000111229  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1599  secreted hydrolase-like protein  31.68 
 
 		 663 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000036978  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0866  hypothetical protein  26.43 
 
 		 306 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3473  hypothetical protein  29.53 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0783282  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3411  hypothetical protein  23.68 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>