37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3473 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3473  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  535  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0783282  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3246  hypothetical protein  82.78 
 
 		 279 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927983  normal  0.115711 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  46.27 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4948  hypothetical protein  45.8 
 
 		 271 aa  178  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000111229  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3291  protein of unknown function DUF422  41.8 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5122  hypothetical protein  43.73 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0730862  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1394  hypothetical protein  41.77 
 
 		 275 aa  138  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326287  hitchhiker  0.000408196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3223  protein of unknown function DUF422  41.22 
 
 		 260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00453975  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3834  membrane protein-like protein  40.2 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3945  hypothetical protein  36.81 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.230705 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  38.46 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0383  hypothetical protein  36.36 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.641319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  31.98 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1489  protein of unknown function DUF422  39.53 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0102  membrane protein-like protein  29.33 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  33.33 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1003  carotene biosynthesis associated membrane protein  42.5 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2309  hypothetical protein  40.68 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1899  carotene biosynthesis associated membrane protein  35.71 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  31.51 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 575 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  29.95 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  40.87 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  33.33 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1362  carotene biosynthesis associated membrane protein  34.64 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2375  carotene biosynthesis associated membrane protein  35.06 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0121546  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2702  carotene biosynthesis associated membrane protein  42.45 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1509  hypothetical protein  26.95 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2732  hypothetical protein  27.54 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1213  hypothetical protein  31.79 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1970  hypothetical protein  31.79 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3702  membrane protein-like protein  24.03 
 
 		 288 aa  48.9  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  33.06 
 
 		 279 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0360  hypothetical protein  24.18 
 
 		 281 aa  45.8  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.970781  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2204  membrane protein-like protein  32.68 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.537082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1273  hypothetical protein  22.22 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.917588  hitchhiker  0.0000000103093 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1898  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>