29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2375 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2375  carotene biosynthesis associated membrane protein  100 
 
 		 294 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0121546  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1362  carotene biosynthesis associated membrane protein  62.28 
 
 		 283 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1899  carotene biosynthesis associated membrane protein  61.09 
 
 		 293 aa  281  6.000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1003  carotene biosynthesis associated membrane protein  54.01 
 
 		 311 aa  277  2e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2702  carotene biosynthesis associated membrane protein  57.8 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2204  membrane protein-like protein  42.06 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.537082  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3246  hypothetical protein  37.69 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927983  normal  0.115711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3473  hypothetical protein  33.55 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0783282  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  29.46 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3945  hypothetical protein  31.47 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.230705 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  30.77 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  25.32 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5122  hypothetical protein  31.58 
 
 		 277 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0730862  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3291  protein of unknown function DUF422  31.47 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  32.82 
 
 		 302 aa  49.3  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  28.85 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  31.5 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  31.58 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3834  membrane protein-like protein  33.58 
 
 		 239 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4948  hypothetical protein  28.91 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000111229  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  32.64 
 
 		 575 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1489  protein of unknown function DUF422  33.06 
 
 		 397 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  28.15 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3411  hypothetical protein  27.88 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0383  hypothetical protein  31.93 
 
 		 344 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.641319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0360  hypothetical protein  26.63 
 
 		 281 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.970781  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0115  hypothetical protein  32.82 
 
 		 242 aa  42.7  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1509  hypothetical protein  27.98 
 
 		 296 aa  42.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454469 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0102  membrane protein-like protein  31.85 
 
 		 242 aa  42.4  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>