34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2204 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2204  membrane protein-like protein  100 
 
 		 254 aa  462  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.537082  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1362  carotene biosynthesis associated membrane protein  53.03 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1899  carotene biosynthesis associated membrane protein  42.94 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1003  carotene biosynthesis associated membrane protein  37.86 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0115  hypothetical protein  40.4 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  35.93 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2702  carotene biosynthesis associated membrane protein  48.44 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2375  carotene biosynthesis associated membrane protein  41.01 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0121546  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  34.04 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  32.31 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  39.39 
 
 		 575 aa  67.4  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1970  hypothetical protein  30.14 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5122  hypothetical protein  34.93 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0730862  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  36.84 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1213  hypothetical protein  32.03 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  32.22 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  34.75 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  29.85 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  32.29 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  35.54 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0102  membrane protein-like protein  32.35 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1394  hypothetical protein  32.97 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326287  hitchhiker  0.000408196 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3473  hypothetical protein  33.96 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0783282  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3834  membrane protein-like protein  42.02 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3291  protein of unknown function DUF422  36.51 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3246  hypothetical protein  38.14 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927983  normal  0.115711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3945  hypothetical protein  31.21 
 
 		 291 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.230705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3223  protein of unknown function DUF422  30.48 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00453975  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0383  hypothetical protein  35.23 
 
 		 344 aa  48.9  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.641319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0360  hypothetical protein  29.87 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.970781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3411  hypothetical protein  28.39 
 
 		 310 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2732  hypothetical protein  31.29 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1509  hypothetical protein  32.52 
 
 		 296 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454469 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1599  secreted hydrolase-like protein  47.37 
 
 		 663 aa  42.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000036978  normal  0.453344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>