36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3246 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3246  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  524  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927983  normal  0.115711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3473  hypothetical protein  82.78 
 
 		 280 aa  391  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0783282  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  46.13 
 
 		 274 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4948  hypothetical protein  46.15 
 
 		 271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000111229  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3291  protein of unknown function DUF422  44.98 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1394  hypothetical protein  42.92 
 
 		 275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326287  hitchhiker  0.000408196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3223  protein of unknown function DUF422  42.86 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00453975  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5122  hypothetical protein  43.44 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0730862  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3834  membrane protein-like protein  39.39 
 
 		 239 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3945  hypothetical protein  40.54 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.230705 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0383  hypothetical protein  42.98 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.641319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1003  carotene biosynthesis associated membrane protein  39.69 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0102  membrane protein-like protein  28.04 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  32.29 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  31.97 
 
 		 239 aa  67  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  39.67 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  37.5 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  32.99 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1899  carotene biosynthesis associated membrane protein  34.29 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  34.65 
 
 		 575 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2309  hypothetical protein  39.37 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  36.29 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1489  protein of unknown function DUF422  35.9 
 
 		 397 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1362  carotene biosynthesis associated membrane protein  37.25 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2375  carotene biosynthesis associated membrane protein  36.81 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0121546  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  34.75 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1213  hypothetical protein  37.5 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2732  hypothetical protein  29.45 
 
 		 296 aa  52.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1509  hypothetical protein  28.83 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454469 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  32.21 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3702  membrane protein-like protein  23.93 
 
 		 288 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2702  carotene biosynthesis associated membrane protein  42.75 
 
 		 308 aa  45.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1970  hypothetical protein  31.82 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0360  hypothetical protein  26.28 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.970781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3411  hypothetical protein  25.95 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1898  hypothetical protein  25.62 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>