36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3223 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3223  protein of unknown function DUF422  100 
 
 		 260 aa  500  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00453975  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4948  hypothetical protein  52.21 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000111229  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  44.22 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3473  hypothetical protein  41.22 
 
 		 280 aa  152  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0783282  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5122  hypothetical protein  48.35 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0730862  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3246  hypothetical protein  43.15 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0927983  normal  0.115711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1394  hypothetical protein  41.96 
 
 		 275 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326287  hitchhiker  0.000408196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3291  protein of unknown function DUF422  37.17 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3834  membrane protein-like protein  41.36 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  32.43 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  34.55 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2309  hypothetical protein  35.67 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  31.22 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  28.19 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  36.3 
 
 		 575 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0383  hypothetical protein  35.48 
 
 		 344 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.641319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1489  protein of unknown function DUF422  36.07 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1003  carotene biosynthesis associated membrane protein  34.67 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1899  carotene biosynthesis associated membrane protein  33.33 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1213  hypothetical protein  28.75 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0102  membrane protein-like protein  28.11 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  32.24 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2375  carotene biosynthesis associated membrane protein  33.58 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0121546  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  30.87 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  29.08 
 
 		 285 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  32.06 
 
 		 295 aa  53.1  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3945  hypothetical protein  36.57 
 
 		 291 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.230705 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2204  membrane protein-like protein  34.27 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.537082  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1362  carotene biosynthesis associated membrane protein  32.48 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1970  hypothetical protein  30.2 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0866  hypothetical protein  26.14 
 
 		 306 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3702  membrane protein-like protein  25.77 
 
 		 288 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1509  hypothetical protein  29 
 
 		 296 aa  45.8  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2732  hypothetical protein  27.07 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1898  hypothetical protein  25.51 
 
 		 290 aa  43.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0360  hypothetical protein  26.25 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.970781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>