23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1273 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1273  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  577  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.917588  hitchhiker  0.0000000103093 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1898  hypothetical protein  80.49 
 
 		 290 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3702  membrane protein-like protein  71.63 
 
 		 288 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2732  hypothetical protein  70.28 
 
 		 296 aa  408  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1509  hypothetical protein  69.93 
 
 		 296 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.454469 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3411  hypothetical protein  63.79 
 
 		 310 aa  350  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0360  hypothetical protein  65.58 
 
 		 281 aa  347  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.970781  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0866  hypothetical protein  52.98 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4078  membrane protein-like protein  40.77 
 
 		 498 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2706  hypothetical protein  28.66 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0151  protein of unknown function DUF422  25.25 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0617441  normal  0.0785259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2275  membrane protein-like protein  29.01 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0426  hypothetical protein  29.73 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2510  protein of unknown function DUF422  28.05 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3100  protein of unknown function DUF422  29.46 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4948  hypothetical protein  25.38 
 
 		 271 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000111229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1513  hypothetical protein  28.48 
 
 		 302 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0146288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1213  hypothetical protein  24.28 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1360  hypothetical protein  25.61 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1899  carotene biosynthesis associated membrane protein  28.57 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2548  protein of unknown function DUF422  23.4 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186293  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1970  hypothetical protein  25.36 
 
 		 280 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  24.67 
 
 		 575 aa  42.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>