105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1642 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1642  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
280 aa  557  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2584  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  59.86 
 
 
280 aa  324  8.000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1502  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  56.99 
 
 
284 aa  299  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2111  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  52.84 
 
 
285 aa  277  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1405  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  49.82 
 
 
286 aa  263  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.289114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1962  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  52 
 
 
284 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0233  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.62 
 
 
291 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1406  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 
318 aa  171  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.151808  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2690  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  36 
 
 
301 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1995  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  37.96 
 
 
301 aa  165  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6246  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  37.55 
 
 
321 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.434954  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3242  UbiA prenyltransferase  35.07 
 
 
310 aa  165  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000441588  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1645  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 
296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0329  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  36.82 
 
 
294 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3731  UbiA prenyltransferase  35.48 
 
 
318 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000383911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1416  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.49 
 
 
320 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000808669  hitchhiker  0.00108845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4052  UbiA prenyltransferase  35.56 
 
 
296 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1465  UbiA prenyltransferase  33.7 
 
 
288 aa  157  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0342243  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4052  UbiA prenyltransferase  33.33 
 
 
295 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0321079  normal  0.0610101 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0169  UbiA prenyltransferase  35.76 
 
 
319 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1948  UbiA prenyltransferase  34.64 
 
 
290 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4030  UbiA prenyltransferase  36.36 
 
 
288 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_002950  PG0509  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  36.82 
 
 
286 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5056  UbiA prenyltransferase  31.73 
 
 
295 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.397977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5061  UbiA prenyltransferase  31.73 
 
 
295 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2248  UbiA prenyltransferase  32.76 
 
 
327 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000928316  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2564  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  37.27 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4060  UbiA prenyltransferase  32.56 
 
 
327 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000422239  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3217  UbiA prenyltransferase  32.6 
 
 
315 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000417906  normal  0.0803548 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3527  UbiA prenyltransferase  34.56 
 
 
304 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1966  UbiA prenyltransferase  34.88 
 
 
301 aa  132  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5665  UbiA prenyltransferase  29.67 
 
 
334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3882  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.98 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0147542 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01330  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  28.72 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.139856  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0207  UbiA prenyltransferase  29.68 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0811  UbiA prenyltransferase  33.46 
 
 
308 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0164  UbiA prenyltransferase  30.63 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1818  UbiA prenyltransferase  28.06 
 
 
335 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2194  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 
331 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  0.405209 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03325  hypothetical protein  32.59 
 
 
288 aa  120  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1013  UbiA prenyltransferase  31.1 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.810785 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1216  UbiA prenyltransferase  30.12 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3500  UbiA prenyltransferase  34.32 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0251416  normal  0.998384 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1739  UbiA prenyltransferase  31.25 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.463163  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5017  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  29.64 
 
 
310 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5105  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  29.64 
 
 
310 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5398  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  29.64 
 
 
310 aa  115  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1026  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.92 
 
 
281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0993  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.92 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1773  UbiA prenyltransferase  33.46 
 
 
312 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143657  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3231  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  28.82 
 
 
326 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2376  UbiA prenyltransferase  33.58 
 
 
293 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00872573 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0803  hypothetical protein  31.52 
 
 
479 aa  105  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0855  hypothetical protein  31.52 
 
 
479 aa  105  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719485  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1710  hypothetical protein  30.8 
 
 
503 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.792915  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13840  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  26.81 
 
 
302 aa  102  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.409705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2460  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.47 
 
 
294 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.372558  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4211  hypothetical protein  32.48 
 
 
482 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1137  hypothetical protein  35.38 
 
 
483 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136806  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1162  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  27.9 
 
 
309 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5647  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  28.68 
 
 
309 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972771  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0269  UbiA prenyltransferase  30.48 
 
 
322 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3980  hypothetical protein  35.43 
 
 
498 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0272963  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5594  hypothetical protein  34.98 
 
 
494 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0500  hypothetical protein  33.14 
 
 
472 aa  97.1  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19137 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2275  hypothetical protein  36.75 
 
 
473 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.493912 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2964  hypothetical protein  31.52 
 
 
479 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4253  hypothetical protein  36.07 
 
 
477 aa  86.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.326142 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0757  hypothetical protein  32.16 
 
 
481 aa  86.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3784  hypothetical protein  34.83 
 
 
474 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7178  hypothetical protein  29.67 
 
 
475 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0936  hypothetical protein  31.2 
 
 
498 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507653  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0898  hypothetical protein  35.47 
 
 
474 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.897817  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0064  hypothetical protein  34.36 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3163  hypothetical protein  34.27 
 
 
508 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147535  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3635  hypothetical protein  35.09 
 
 
479 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3487  hypothetical protein  34.46 
 
 
508 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2829  hypothetical protein  31.69 
 
 
460 aa  79.3  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0400356  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5788  hypothetical protein  32.4 
 
 
484 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2161  hypothetical protein  31.65 
 
 
484 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4796  hypothetical protein  30.08 
 
 
631 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1029  hypothetical protein  28.47 
 
 
485 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2303  hypothetical protein  30.25 
 
 
483 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223349  normal  0.0447884 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0173  hypothetical protein  35.84 
 
 
474 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3359  hypothetical protein  34.27 
 
 
521 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1976  UbiA prenyltransferase  25.42 
 
 
344 aa  67  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000257247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0134  UbiA prenyltransferase  24.58 
 
 
180 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00304633  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0132  putative transmembrane potein  35.85 
 
 
124 aa  59.3  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0144788  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7263  UbiA prenyltransferase  31.58 
 
 
300 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000688363  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3100  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  33.33 
 
 
322 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  33 
 
 
280 aa  45.8  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  30.13 
 
 
282 aa  45.8  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0159  protoheme IX farnesyltransferase (cytochrome o ubiquinol oxidase C subunit IV)  27.82 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  28.91 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  26.67 
 
 
300 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  30.77 
 
 
317 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3080  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.39 
 
 
320 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  27.37 
 
 
301 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0160  UbiA prenyltransferase  23.94 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000799272  hitchhiker  0.000000000000598028 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2886  protoheme IX farnesyltransferase  28.47 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>