90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0160 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0160  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 291 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000799272  hitchhiker  0.000000000000598028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7263  UbiA prenyltransferase  56.9 
 
 		 300 aa  300  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000688363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2883  UbiA prenyltransferase  52.58 
 
 		 289 aa  296  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0429  UbiA prenyltransferase  54.9 
 
 		 292 aa  290  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.910101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2286  UbiA prenyltransferase  48.63 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.3473 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2631  UbiA prenyltransferase  37.04 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11100  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  30.98 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0780  UbiA prenyltransferase  31.56 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1557  UbiA prenyltransferase  35.36 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0986  UbiA prenyltransferase  30.59 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.665477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  31.4 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  33.33 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2325  UbiA prenyltransferase  28.74 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00527933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  34.31 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  28.95 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  30.95 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  34.38 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  29.95 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0806  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.78 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.196063  hitchhiker  0.00946917 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0288  UbiA prenyltransferase  30.73 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.16612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  33.1 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  28.15 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1824  UbiA prenyltransferase  28.5 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.547794  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  27.87 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  28.89 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0771  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  32.65 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0487917  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  32.74 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  34.38 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1730  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  27.41 
 
 		 278 aa  52.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  32.65 
 
 		 279 aa  52.8  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0316  prenyltransferase  38.18 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.65204e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20661  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.46 
 
 		 336 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  26.67 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2426  UbiA prenyltransferase  32.84 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1958  prenyltransferase  25.97 
 
 		 313 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2084  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.47 
 
 		 339 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.748804 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2470  UbiA prenyltransferase  29.56 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0292823  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1573  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.68 
 
 		 317 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0576608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  26.88 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04521  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.91 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04831  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.91 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0427  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.91 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.09 
 
 		 376 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3341  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.03622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3669  UbiA prenyltransferase  29.59 
 
 		 185 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000695269  normal  0.0238668 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2757  UbiA prenyltransferase  32.23 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1742  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  42.55 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0545  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  40.82 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.659162  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4380  UbiA prenyltransferase  33.08 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1605  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  40.82 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1210  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  31.54 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.441233  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0951  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  35.14 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  35.16 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16384  predicted protein  28.3 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.960686  normal  0.418422 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0940  UbiA prenyltransferase  25.29 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.500041  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0602  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  38.3 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.171113  normal  0.0295962 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04901  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.46 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0876  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.52 
 
 		 326 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0708  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  39.58 
 
 		 332 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.630035  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3844  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.33 
 
 		 340 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1089  UbiA prenyltransferase  30.68 
 
 		 313 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1759  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.91 
 
 		 316 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0630  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  38.78 
 
 		 330 aa  45.8  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.774634  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04811  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.91 
 
 		 316 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.233119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04241  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.91 
 
 		 316 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.97 
 
 		 299 aa  45.8  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0020  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  27.52 
 
 		 343 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  32.81 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.81 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2690  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  24.22 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46085  predicted protein  27.87 
 
 		 423 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.232641  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1782  UbiA prenyltransferase  27.67 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1390  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.69 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.937819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2227  bacteriochlorophyll c synthase  35.82 
 
 		 335 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0583  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  38.3 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0053  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.03 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0716312  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0977  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  26.52 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.92785  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5382  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  38.67 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1449  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.93 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.482254  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1642  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  23.94 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1998  bacteriochlorophyll c synthase  39.13 
 
 		 333 aa  43.5  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1658  protoheme IX farnesyltransferase  29.81 
 
 		 315 aa  43.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1016  UbiA prenyltransferase  38.04 
 
 		 284 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12008  Maf-like protein  28.05 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0238  bacteriochlorophyll c synthase  43.33 
 
 		 334 aa  42.7  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.325704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0857  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  28.57 
 
 		 316 aa  42.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  0.0717039 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  31.11 
 
 		 277 aa  42.4  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0897  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  28.57 
 
 		 316 aa  42.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.841681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0811  UbiA prenyltransferase  26.45 
 
 		 308 aa  42.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1302  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  36.92 
 
 		 303 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>