92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1739 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1739  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 309 aa  598  1e-170  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.463163  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0207  UbiA prenyltransferase  44.64 
 
 		 308 aa  236  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5665  UbiA prenyltransferase  42.41 
 
 		 334 aa  232  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0164  UbiA prenyltransferase  43.79 
 
 		 306 aa  228  8e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01330  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  44.17 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.139856  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5105  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  44.52 
 
 		 310 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5398  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  44.52 
 
 		 310 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5017  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  44.52 
 
 		 310 aa  215  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1162  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  43.91 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5647  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972771  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0811  UbiA prenyltransferase  46.64 
 
 		 308 aa  209  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13840  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  43.43 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.409705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3882  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0147542 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2376  UbiA prenyltransferase  45.77 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00872573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2460  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  46.82 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.372558  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2194  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  37.63 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  0.405209 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1995  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  38.8 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2584  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.23 
 
 		 280 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0269  UbiA prenyltransferase  40.87 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5061  UbiA prenyltransferase  35.99 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5056  UbiA prenyltransferase  35.99 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.397977  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1416  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.09 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000808669  hitchhiker  0.00108845 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0169  UbiA prenyltransferase  34.68 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1645  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  37.59 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3242  UbiA prenyltransferase  33.44 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000441588  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0233  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  30.66 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1406  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.151808  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1405  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.97 
 
 		 286 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.289114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4030  UbiA prenyltransferase  38.49 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2690  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1818  UbiA prenyltransferase  30.56 
 
 		 335 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3217  UbiA prenyltransferase  35.41 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000417906  normal  0.0803548 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2111  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1502  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  36.43 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130276  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0329  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.67 
 
 		 294 aa  139  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6246  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  36.77 
 
 		 321 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.434954  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3231  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03325  hypothetical protein  32.14 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3731  UbiA prenyltransferase  33.81 
 
 		 318 aa  132  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000383911  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4060  UbiA prenyltransferase  34.17 
 
 		 327 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000422239  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1642  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.27 
 
 		 280 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1948  UbiA prenyltransferase  35.38 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1962  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3527  UbiA prenyltransferase  32.2 
 
 		 304 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2248  UbiA prenyltransferase  31.97 
 
 		 327 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000928316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0509  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.15 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1465  UbiA prenyltransferase  27.41 
 
 		 288 aa  119  7.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0342243  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3500  UbiA prenyltransferase  36.63 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0251416  normal  0.998384 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1966  UbiA prenyltransferase  34.91 
 
 		 301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4052  UbiA prenyltransferase  32.73 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0321079  normal  0.0610101 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4253  hypothetical protein  38.64 
 
 		 477 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.326142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1137  hypothetical protein  37.32 
 
 		 483 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1013  UbiA prenyltransferase  33.45 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.810785 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0500  hypothetical protein  36.1 
 
 		 472 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19137 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2564  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1773  UbiA prenyltransferase  33.33 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5594  hypothetical protein  36.84 
 
 		 494 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3980  hypothetical protein  40.45 
 
 		 498 aa  99  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1216  UbiA prenyltransferase  31.01 
 
 		 268 aa  98.6  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0993  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 		 281 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4052  UbiA prenyltransferase  32.66 
 
 		 296 aa  95.9  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2829  hypothetical protein  34.26 
 
 		 460 aa  95.5  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0400356  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2161  hypothetical protein  33.02 
 
 		 484 aa  95.1  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1026  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 		 281 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2275  hypothetical protein  32.98 
 
 		 473 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4211  hypothetical protein  35.75 
 
 		 482 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1710  hypothetical protein  37.57 
 
 		 503 aa  90.1  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.792915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0064  hypothetical protein  36.79 
 
 		 489 aa  90.1  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5788  hypothetical protein  35.43 
 
 		 484 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2964  hypothetical protein  33.33 
 
 		 479 aa  89.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7178  hypothetical protein  36.46 
 
 		 475 aa  89.4  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0803  hypothetical protein  33.16 
 
 		 479 aa  88.6  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0855  hypothetical protein  33.16 
 
 		 479 aa  88.2  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719485  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0757  hypothetical protein  39.33 
 
 		 481 aa  89  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4796  hypothetical protein  31.76 
 
 		 631 aa  86.3  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3635  hypothetical protein  30.6 
 
 		 479 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1029  hypothetical protein  33.69 
 
 		 485 aa  78.2  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3487  hypothetical protein  37.99 
 
 		 508 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0936  hypothetical protein  40.83 
 
 		 498 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507653  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3163  hypothetical protein  36.87 
 
 		 508 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3784  hypothetical protein  34.54 
 
 		 474 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0898  hypothetical protein  33.16 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.897817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2303  hypothetical protein  32.29 
 
 		 483 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223349  normal  0.0447884 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0173  hypothetical protein  37.06 
 
 		 474 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0134  UbiA prenyltransferase  28.57 
 
 		 180 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00304633  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3359  hypothetical protein  38.55 
 
 		 521 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0132  putative transmembrane potein  31.19 
 
 		 124 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0144788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6496  UbiA prenyltransferase  29.65 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2703  UbiA prenyltransferase  33.33 
 
 		 290 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  26.26 
 
 		 534 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1976  UbiA prenyltransferase  26.53 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000257247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  26.95 
 
 		 535 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>