77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2703 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2703  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
290 aa  566  1e-160  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1002  UbiA prenyltransferase  76.53 
 
 
340 aa  429  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2374  prenyltransferase  63.23 
 
 
293 aa  353  2e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0270715  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1898  prenyltransferase  68.13 
 
 
299 aa  338  8e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.622194 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1361  UbiA prenyltransferase  62.14 
 
 
296 aa  328  5.0000000000000004e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.321745 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2047  UbiA prenyltransferase  42.54 
 
 
287 aa  196  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0118  prenyltransferase  39.55 
 
 
284 aa  163  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2205  prenyltransferase  37.34 
 
 
283 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3488  prenyltransferase  37.25 
 
 
300 aa  106  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12800  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  33.64 
 
 
318 aa  97.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181284  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13800  prenyltransferase  33.78 
 
 
294 aa  97.4  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0993725  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04400  prenyltransferase  34.29 
 
 
294 aa  95.9  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0337  prenyltransferase  33.78 
 
 
286 aa  92.8  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0802172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2888  UbiA prenyltransferase  35.48 
 
 
289 aa  92.4  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0837805 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21210  prenyltransferase  36.11 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0848  prenyltransferase  35.29 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0221544  normal  0.0909902 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2738  predicted protein  30.11 
 
 
235 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3472  tocopherol phytyltransferase  27.24 
 
 
318 aa  58.9  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00788485  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0012  tocopherol phytyltransferase  25.68 
 
 
318 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0002  tocopherol phytyltransferase  24.26 
 
 
299 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  32.81 
 
 
315 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0010  tocopherol phytyltransferase  25.68 
 
 
318 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  24.89 
 
 
333 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3881  tocopherol phytyltransferase  25.64 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.630797  decreased coverage  0.00732369 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0726  tocopherol phytyltransferase  28.93 
 
 
314 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00119936  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2360  bacteriochlorophyll c synthase  24 
 
 
333 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.663632  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1088  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  35.03 
 
 
284 aa  52.8  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0563652  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0386  tocopherol phytyltransferase  30.11 
 
 
300 aa  52.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000735368  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1811  prenyltransferase  26.46 
 
 
286 aa  52  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0588  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.91 
 
 
322 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.262938 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1600  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.23 
 
 
305 aa  49.3  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1998  bacteriochlorophyll c synthase  23.9 
 
 
333 aa  48.5  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2227  bacteriochlorophyll c synthase  24.23 
 
 
335 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.78 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3752  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.37 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  hitchhiker  0.000466186 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1210  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  27.71 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.441233  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0218  prenyltransferase  28 
 
 
289 aa  47.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1538  bacteriochlorophyll c synthase  24.19 
 
 
338 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0627  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.61 
 
 
303 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0876  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.54 
 
 
326 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3462  UbiA prenyltransferase  26.32 
 
 
313 aa  47  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.54 
 
 
299 aa  46.6  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5382  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.86 
 
 
315 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2226  bacteriochlorophyll c synthase  23.91 
 
 
336 aa  46.2  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3747  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.57 
 
 
297 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0824  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.18 
 
 
316 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129328  normal  0.188314 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2242  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.8 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161833  normal  0.0898347 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0941  bacteriochlorophyll c synthase  25.15 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.5 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0818  prenyltransferase  27.16 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00247672  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2330  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.8 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0806  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.13 
 
 
317 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.196063  hitchhiker  0.00946917 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1605  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.42 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04241  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.67 
 
 
316 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5287  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.17 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111529  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.51 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.17 
 
 
295 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0238  bacteriochlorophyll c synthase  23.62 
 
 
334 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.325704  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.29 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_004310  BR0415  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.21 
 
 
333 aa  43.9  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.638328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0423  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.21 
 
 
333 aa  44.3  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1642  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.18 
 
 
301 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6496  UbiA prenyltransferase  30.34 
 
 
328 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518447  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5031  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  31.79 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  27.81 
 
 
283 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01330  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  30.67 
 
 
308 aa  43.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.139856  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3341  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.37 
 
 
337 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.03622 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2096  prenyltransferase  27.5 
 
 
301 aa  42.7  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0368  bacteriochlorophyll c synthase  23.28 
 
 
335 aa  42.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.259035  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3733  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.53 
 
 
292 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000311091  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3913  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.24 
 
 
318 aa  42.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3679  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.81 
 
 
292 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_87025  Para-hydroxybenzoate--polyprenyltransferase, mitochondrial precursor (PHB:polyprenyltransferase)  30 
 
 
285 aa  42.7  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0897  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  28.99 
 
 
316 aa  42.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.841681 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1101  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  25.83 
 
 
302 aa  42.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0596  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.15 
 
 
295 aa  42.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0020  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  26.05 
 
 
343 aa  42.4  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>