22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0848 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0848  prenyltransferase  100 
 
 
292 aa  540  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0221544  normal  0.0909902 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2205  prenyltransferase  50.35 
 
 
283 aa  209  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2047  UbiA prenyltransferase  39.26 
 
 
287 aa  122  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0337  prenyltransferase  34.22 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0802172 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13800  prenyltransferase  36.44 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0993725  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3488  prenyltransferase  35.89 
 
 
300 aa  109  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04400  prenyltransferase  35.32 
 
 
294 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2703  UbiA prenyltransferase  35.38 
 
 
290 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2888  UbiA prenyltransferase  37.5 
 
 
289 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0837805 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1361  UbiA prenyltransferase  33.81 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.321745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12800  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  35.19 
 
 
318 aa  96.7  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181284  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1002  UbiA prenyltransferase  35.02 
 
 
340 aa  95.5  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2374  prenyltransferase  34.93 
 
 
293 aa  95.5  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0270715  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21210  prenyltransferase  37.04 
 
 
294 aa  86.7  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1898  prenyltransferase  33.64 
 
 
299 aa  85.5  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.622194 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0118  prenyltransferase  38.07 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3462  UbiA prenyltransferase  29.28 
 
 
313 aa  47  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.5 
 
 
303 aa  46.2  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2249  UbiA prenyltransferase  31.41 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3472  tocopherol phytyltransferase  29.01 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00788485  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0386  tocopherol phytyltransferase  27.65 
 
 
300 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000735368  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0726  tocopherol phytyltransferase  31.18 
 
 
314 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00119936  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>