82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0386 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0386  tocopherol phytyltransferase  100 
 
 
300 aa  591  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000735368  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3881  tocopherol phytyltransferase  41.1 
 
 
349 aa  215  9e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.630797  decreased coverage  0.00732369 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0002  tocopherol phytyltransferase  41.52 
 
 
299 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0726  tocopherol phytyltransferase  39.47 
 
 
314 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00119936  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3472  tocopherol phytyltransferase  39.39 
 
 
318 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00788485  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3462  UbiA prenyltransferase  38.89 
 
 
313 aa  195  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0010  tocopherol phytyltransferase  40.07 
 
 
318 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0012  tocopherol phytyltransferase  40.07 
 
 
318 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47601  predicted protein  35.48 
 
 
404 aa  146  5e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32069  predicted protein  34.24 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2738  predicted protein  35.15 
 
 
235 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119481  homogentisate phytylprenyltransferase/homogentisic acid geranylgeranyl transferase  32.41 
 
 
387 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18364  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0368  bacteriochlorophyll c synthase  27.43 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.259035  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  27.49 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2226  bacteriochlorophyll c synthase  25.42 
 
 
336 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1998  bacteriochlorophyll c synthase  27.45 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0209  bacteriochlorophyll c synthase  28.66 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  25.14 
 
 
333 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2360  bacteriochlorophyll c synthase  24 
 
 
333 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.663632  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5287  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.37 
 
 
295 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111529  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1538  bacteriochlorophyll c synthase  27.37 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2227  bacteriochlorophyll c synthase  27.22 
 
 
335 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25 
 
 
295 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0238  bacteriochlorophyll c synthase  25.84 
 
 
334 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.325704  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1390  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.84 
 
 
334 aa  57.4  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.937819  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  28.38 
 
 
282 aa  56.6  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.63 
 
 
274 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  28.77 
 
 
284 aa  56.2  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3747  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.37 
 
 
297 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1600  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.08 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2061  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.53 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.93 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1210  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  27.95 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.441233  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6422  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.96 
 
 
300 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.46 
 
 
300 aa  53.9  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.57 
 
 
303 aa  52.8  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  28.92 
 
 
279 aa  52.4  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0941  bacteriochlorophyll c synthase  24 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0602  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.05 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.171113  normal  0.0295962 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0583  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.34 
 
 
320 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1089  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.32 
 
 
333 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.26 
 
 
299 aa  50.4  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1898  prenyltransferase  27.78 
 
 
299 aa  50.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.622194 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0545  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.35 
 
 
330 aa  50.4  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.659162  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0876  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.14 
 
 
326 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.06 
 
 
376 aa  49.7  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2703  UbiA prenyltransferase  29.57 
 
 
290 aa  49.7  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2480  prenyltransferase  29.13 
 
 
293 aa  49.3  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0220727  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1742  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.73 
 
 
276 aa  48.9  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0627  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.17 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1605  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.4 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0630  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.52 
 
 
330 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.774634  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  26.36 
 
 
283 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2374  prenyltransferase  27.65 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0270715  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0020  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  25.39 
 
 
343 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0708  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.86 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.630035  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1145  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.97 
 
 
333 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3341  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.88 
 
 
337 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.03622 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46085  predicted protein  24.63 
 
 
423 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.232641  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16384  predicted protein  25.35 
 
 
317 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.960686  normal  0.418422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.81 
 
 
318 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1852  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.52 
 
 
294 aa  47  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409299 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  28.85 
 
 
281 aa  47  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12008  Maf-like protein  29.9 
 
 
283 aa  46.2  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2084  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.62 
 
 
339 aa  45.8  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.748804 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1101  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  25 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1449  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.59 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.482254  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3485  UbiA prenyltransferase  28.49 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20661  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.45 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2065  UbiA prenyltransferase  29.68 
 
 
245 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1573  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.62 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0576608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  28.87 
 
 
288 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3530  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.39 
 
 
301 aa  43.9  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.47035 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04831  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.44 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1361  UbiA prenyltransferase  30.12 
 
 
296 aa  43.1  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.321745 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04521  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.44 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1922  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.61 
 
 
302 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1733  UbiA prenyltransferase  32.53 
 
 
276 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  24.58 
 
 
285 aa  42.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  27.85 
 
 
281 aa  42.4  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0279  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.08 
 
 
302 aa  42.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0728517  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1719  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.16 
 
 
297 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.641378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>