20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3488 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3488  prenyltransferase  100 
 
 		 300 aa  581  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2888  UbiA prenyltransferase  71.38 
 
 		 289 aa  363  3e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0837805 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0337  prenyltransferase  50.17 
 
 		 286 aa  259  5.0000000000000005e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0802172 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13800  prenyltransferase  51.01 
 
 		 294 aa  256  3e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0993725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12800  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  51.19 
 
 		 318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04400  prenyltransferase  52.03 
 
 		 294 aa  241  7e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21210  prenyltransferase  48.84 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2205  prenyltransferase  36.61 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2047  UbiA prenyltransferase  34.41 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2374  prenyltransferase  35.69 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0270715  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2703  UbiA prenyltransferase  36.36 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1361  UbiA prenyltransferase  34.82 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.321745 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1002  UbiA prenyltransferase  33.11 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1898  prenyltransferase  34.51 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.622194 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0118  prenyltransferase  31.43 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0623  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.17 
 
 		 507 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0848  prenyltransferase  37.84 
 
 		 292 aa  49.3  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0221544  normal  0.0909902 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  27.13 
 
 		 333 aa  45.8  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2248  UbiA prenyltransferase  31.33 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000928316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2360  bacteriochlorophyll c synthase  24.81 
 
 		 333 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.663632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>