20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12800 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_12800  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  100 
 
 		 318 aa  627  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04400  prenyltransferase  61.49 
 
 		 294 aa  350  3e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0337  prenyltransferase  55.24 
 
 		 286 aa  300  1e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0802172 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13800  prenyltransferase  54.08 
 
 		 294 aa  294  1e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0993725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2888  UbiA prenyltransferase  54.18 
 
 		 289 aa  275  6e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0837805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3488  prenyltransferase  50.84 
 
 		 300 aa  265  5.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21210  prenyltransferase  55.02 
 
 		 294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2205  prenyltransferase  35.17 
 
 		 283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2047  UbiA prenyltransferase  33.72 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1002  UbiA prenyltransferase  32.61 
 
 		 340 aa  97.1  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1361  UbiA prenyltransferase  36.56 
 
 		 296 aa  97.1  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.321745 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2703  UbiA prenyltransferase  29.8 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2374  prenyltransferase  33.04 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0270715  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1898  prenyltransferase  33.02 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.622194 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0118  prenyltransferase  30.83 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0848  prenyltransferase  37.5 
 
 		 292 aa  47  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0221544  normal  0.0909902 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0002  tocopherol phytyltransferase  25.11 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0012  tocopherol phytyltransferase  28.03 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0209  bacteriochlorophyll c synthase  28.21 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0010  tocopherol phytyltransferase  28.03 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>