22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04400 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_04400  prenyltransferase  100 
 
 		 294 aa  570  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12800  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  63.19 
 
 		 318 aa  346  3e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13800  prenyltransferase  57.39 
 
 		 294 aa  306  3e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0993725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0337  prenyltransferase  56.27 
 
 		 286 aa  296  3e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0802172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2888  UbiA prenyltransferase  59.15 
 
 		 289 aa  290  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0837805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3488  prenyltransferase  52.03 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21210  prenyltransferase  57.95 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2205  prenyltransferase  37.5 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2047  UbiA prenyltransferase  34.8 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2374  prenyltransferase  35.52 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0270715  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1361  UbiA prenyltransferase  40.36 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.321745 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2703  UbiA prenyltransferase  34.22 
 
 		 290 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1002  UbiA prenyltransferase  33.79 
 
 		 340 aa  95.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1898  prenyltransferase  36.15 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.622194 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0118  prenyltransferase  35.43 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0848  prenyltransferase  35.02 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0221544  normal  0.0909902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1302  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.1 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  30.53 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1852  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.32 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409299 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0386  tocopherol phytyltransferase  25.66 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000735368  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  29.9 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2757  UbiA prenyltransferase  46 
 
 		 324 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>