20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13800 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_13800  prenyltransferase  100 
 
 		 294 aa  575  1.0000000000000001e-163  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0993725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04400  prenyltransferase  58.06 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12800  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  55.28 
 
 		 318 aa  279  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0337  prenyltransferase  53.5 
 
 		 286 aa  278  5e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0802172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2888  UbiA prenyltransferase  54.36 
 
 		 289 aa  267  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0837805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3488  prenyltransferase  51.01 
 
 		 300 aa  256  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21210  prenyltransferase  56.55 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2205  prenyltransferase  37.66 
 
 		 283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2374  prenyltransferase  33.45 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0270715  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2703  UbiA prenyltransferase  33.78 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2047  UbiA prenyltransferase  32.77 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1002  UbiA prenyltransferase  33.33 
 
 		 340 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1361  UbiA prenyltransferase  32.86 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.321745 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1898  prenyltransferase  34.55 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.622194 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0848  prenyltransferase  36 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0221544  normal  0.0909902 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0118  prenyltransferase  31.96 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  29.94 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1416  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  28.1 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000808669  hitchhiker  0.00108845 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1016  UbiA prenyltransferase  27.43 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0209  bacteriochlorophyll c synthase  25.98 
 
 		 334 aa  42.7  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>