29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2205 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2205  prenyltransferase  100 
 
 		 283 aa  546  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0848  prenyltransferase  50.35 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0221544  normal  0.0909902 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3488  prenyltransferase  34.53 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2374  prenyltransferase  38.93 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0270715  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2888  UbiA prenyltransferase  35.51 
 
 		 289 aa  122  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0837805 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1361  UbiA prenyltransferase  37.83 
 
 		 296 aa  122  9e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.321745 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2047  UbiA prenyltransferase  37.14 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13800  prenyltransferase  38.1 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0993725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04400  prenyltransferase  38.18 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0337  prenyltransferase  36.79 
 
 		 286 aa  112  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0802172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12800  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  35.96 
 
 		 318 aa  112  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2703  UbiA prenyltransferase  38.81 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1002  UbiA prenyltransferase  36 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1898  prenyltransferase  38.42 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.622194 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21210  prenyltransferase  32.99 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0118  prenyltransferase  34.91 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1642  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.1 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000163597  hitchhiker  0.000177329 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  30.48 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0439  prenyltransferase  31.21 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  28.03 
 
 		 282 aa  46.2  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0160  prenyltransferase  23.26 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.579339  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1429  prenyltransferase  25.35 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0200  prenyltransferase  22.94 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0369  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  32.41 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.1864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1210  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  24.19 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.441233  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0179  prenyltransferase  23.16 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1600  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.24 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1302  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.95 
 
 		 303 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2097  UbiA prenyltransferase  23.53 
 
 		 288 aa  42  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>