More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0439 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0439  prenyltransferase  100 
 
 
298 aa  587  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3393  prenyltransferase  82.83 
 
 
298 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.604924  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0216  prenyltransferase  74.48 
 
 
289 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0232  prenyltransferase  73.78 
 
 
289 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4282  prenyltransferase  73.61 
 
 
290 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0290  prenyltransferase  72.98 
 
 
294 aa  411  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0397  prenyltransferase  70.57 
 
 
288 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0578839  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1642  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  49.82 
 
 
288 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000163597  hitchhiker  0.000177329 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0096  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.36 
 
 
285 aa  273  4.0000000000000004e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3612  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  53 
 
 
287 aa  270  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1451  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  46.34 
 
 
294 aa  257  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0139046  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0316  prenyltransferase  55.71 
 
 
294 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.65204e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2196  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  48.23 
 
 
284 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1088  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  46.81 
 
 
284 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0563652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0678  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  47.12 
 
 
282 aa  248  9e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0184181  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1490  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.25 
 
 
285 aa  239  5.999999999999999e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512063  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2388  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  47.48 
 
 
283 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306171  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0256  prenyltransferase  44.72 
 
 
314 aa  230  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.991703  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1811  prenyltransferase  42.31 
 
 
286 aa  228  7e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3210  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  44.6 
 
 
290 aa  222  7e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0129824  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  47.08 
 
 
288 aa  220  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0176  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  47.5 
 
 
286 aa  219  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0715636  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3374  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  43.66 
 
 
287 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0975  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.14 
 
 
288 aa  217  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0516  prenyltransferase  42.71 
 
 
319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6114  prenyltransferase  41.1 
 
 
315 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8072  prenyltransferase  43.6 
 
 
315 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14810  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  40.43 
 
 
287 aa  209  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1902  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  43.9 
 
 
288 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1429  prenyltransferase  38.73 
 
 
291 aa  206  4e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2015  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  43.6 
 
 
287 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0823  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.96 
 
 
311 aa  201  9e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167929  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1038  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.8 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0379188  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1337  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  44.49 
 
 
286 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4513  prenyltransferase  41.38 
 
 
316 aa  198  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3757  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  44.8 
 
 
298 aa  199  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.987764  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0651  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  44.32 
 
 
303 aa  198  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00254514  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1392  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  42.5 
 
 
285 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0324  prenyltransferase  42.24 
 
 
290 aa  193  3e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0200  prenyltransferase  38.28 
 
 
294 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4093  prenyltransferase  42.09 
 
 
316 aa  189  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0288  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  44.68 
 
 
294 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1159  prenyltransferase  40.77 
 
 
286 aa  188  8e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.848518  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0160  prenyltransferase  37.93 
 
 
294 aa  187  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.579339  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0218  prenyltransferase  40.93 
 
 
289 aa  188  1e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0154  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.3 
 
 
289 aa  187  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.383196  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0179  prenyltransferase  37.24 
 
 
294 aa  185  8e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2205  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  45.39 
 
 
294 aa  183  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0818  prenyltransferase  37.02 
 
 
289 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00247672  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2322  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  42.76 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4209  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  45.85 
 
 
301 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102097  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0369  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  38.33 
 
 
286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.1864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0397  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.64 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0398  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  37.44 
 
 
286 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.967191  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2096  prenyltransferase  31.51 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1101  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.77 
 
 
302 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0492  prenyltransferase  32.31 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.203515  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1512  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  35.96 
 
 
293 aa  99  9e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.378404  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0609  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  33.33 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000295673 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1574  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  34.06 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000853939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0477  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.97 
 
 
321 aa  94  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.036458  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0415  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.5 
 
 
333 aa  92  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.638328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0423  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.5 
 
 
333 aa  92  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0572  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.37 
 
 
307 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0824  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.57 
 
 
316 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129328  normal  0.188314 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00272  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.69 
 
 
284 aa  90.1  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5382  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  28.74 
 
 
315 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0530  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.63 
 
 
342 aa  89.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0857  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.67 
 
 
316 aa  89  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  0.0717039 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0897  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.91 
 
 
316 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.841681 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0543  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.92 
 
 
319 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00391921  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2939  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  32.14 
 
 
294 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105208  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02871  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.77 
 
 
299 aa  86.7  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0588  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.82 
 
 
322 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.262938 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5476  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.27 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1703  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  34.8 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00297592 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0965  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.17 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291497  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2895  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.34 
 
 
285 aa  82.8  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5604  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.12 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3384  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.53 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0413  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.73 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002146  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  26.77 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2519  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  28.15 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  0.917266 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0824  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.91 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3837  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.63 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0373903  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0715  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.53 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.959768 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0582  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.34 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00112694  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0053  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.74 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0716312  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0645  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.95 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5031  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.5 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0619  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.4 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2283  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.35 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642168 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2562  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.17 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2611  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.67 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0044  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.74 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2904  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  33.33 
 
 
329 aa  77  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.520314 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0965  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.85 
 
 
299 aa  77  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271339  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0653  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  31.72 
 
 
340 aa  77  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.110294  normal  0.440734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0363  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.67 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0581  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  24.07 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00583623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>