241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0492 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0492  prenyltransferase  100 
 
 
302 aa  593  1e-168  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.203515  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3374  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.3 
 
 
287 aa  139  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3393  prenyltransferase  33.45 
 
 
298 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.604924  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2388  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.27 
 
 
283 aa  122  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306171  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0439  prenyltransferase  32.31 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14810  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.77 
 
 
287 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0823  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.37 
 
 
311 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167929  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0232  prenyltransferase  32.98 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2196  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  34.09 
 
 
284 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0216  prenyltransferase  33.33 
 
 
289 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0256  prenyltransferase  30.24 
 
 
314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.991703  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0096  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.34 
 
 
285 aa  116  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3210  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  33.33 
 
 
290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0129824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1642  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  35.37 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000163597  hitchhiker  0.000177329 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0975  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  41.07 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0516  prenyltransferase  28.42 
 
 
319 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6114  prenyltransferase  29.33 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2015  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  31.29 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1451  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  33.61 
 
 
294 aa  112  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0139046  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0678  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  36.56 
 
 
282 aa  112  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0184181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0397  prenyltransferase  30.79 
 
 
288 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0578839  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1429  prenyltransferase  31.01 
 
 
291 aa  112  9e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8072  prenyltransferase  31.9 
 
 
315 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1337  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.64 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4093  prenyltransferase  28.78 
 
 
316 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0290  prenyltransferase  31.44 
 
 
294 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1490  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  33.63 
 
 
285 aa  109  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512063  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0651  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  35.04 
 
 
303 aa  109  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00254514  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  34.6 
 
 
288 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1088  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  32.02 
 
 
284 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0563652  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4282  prenyltransferase  33.68 
 
 
290 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0176  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.39 
 
 
286 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0715636  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1392  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.88 
 
 
285 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4513  prenyltransferase  28.78 
 
 
316 aa  105  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1902  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.96 
 
 
288 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0160  prenyltransferase  33.19 
 
 
294 aa  103  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.579339  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0179  prenyltransferase  32.76 
 
 
294 aa  102  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1038  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.1 
 
 
283 aa  101  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0379188  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0200  prenyltransferase  32.76 
 
 
294 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3757  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.96 
 
 
298 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.987764  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0818  prenyltransferase  30.9 
 
 
289 aa  100  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00247672  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0218  prenyltransferase  29.33 
 
 
289 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2205  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  31.36 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1159  prenyltransferase  29.51 
 
 
286 aa  98.2  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.848518  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0369  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  35.48 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.1864  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0324  prenyltransferase  27.72 
 
 
290 aa  93.2  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0316  prenyltransferase  32.37 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.65204e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2322  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  34.36 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0397  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  34.87 
 
 
286 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1512  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  34.04 
 
 
293 aa  90.9  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.378404  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0154  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  26.71 
 
 
289 aa  87.4  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.383196  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0609  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  33.15 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000295673 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0398  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  35.53 
 
 
286 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.967191  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1811  prenyltransferase  27.27 
 
 
286 aa  86.3  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4209  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  33.77 
 
 
301 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102097  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0288  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  33.04 
 
 
294 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2096  prenyltransferase  31.41 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3612  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  29.77 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1574  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  32.62 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000853939 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0140  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.91 
 
 
287 aa  77  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.654949  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2048  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.91 
 
 
287 aa  77  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0469  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.34 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1101  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.28 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4497  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.47 
 
 
286 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0633254  normal  0.801833 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1703  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  34.43 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00297592 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3384  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.74 
 
 
286 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.61 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.24 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00272  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25.89 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1503  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  26.17 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.943321 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.07 
 
 
327 aa  63.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884391  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0897  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  28.12 
 
 
316 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.841681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0857  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  28.12 
 
 
316 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  0.0717039 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2247  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.81 
 
 
322 aa  63.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0799329  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0477  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.77 
 
 
321 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.036458  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1336  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.38 
 
 
292 aa  63.2  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4142  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.25 
 
 
293 aa  63.2  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.356002  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3837  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.76 
 
 
299 aa  63.2  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0373903  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2895  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.16 
 
 
285 aa  62.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0824  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.5 
 
 
316 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129328  normal  0.188314 
 
 
-
 
NC_004310  BR0415  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.07 
 
 
333 aa  62.8  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.638328  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0363  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.08 
 
 
324 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1344  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.36 
 
 
316 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.256325  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00072  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25.48 
 
 
286 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0543  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.45 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00391921  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4711  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.27 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1786  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.38 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0588  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.44 
 
 
322 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.262938 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5382  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.78 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3595  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  32.78 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0530  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.19 
 
 
342 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0581  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.49 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00583623  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0423  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.37 
 
 
333 aa  61.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2246  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  26.9 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0326669  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0441  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.22 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.351552  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4114  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  26.71 
 
 
316 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0582  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.53 
 
 
295 aa  60.1  0.00000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00112694  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0965  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.28 
 
 
317 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291497  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002146  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  26.92 
 
 
284 aa  60.1  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0965  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.81 
 
 
299 aa  59.7  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>