More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1337 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1337  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  100 
 
 
286 aa  565  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2015  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  68.53 
 
 
287 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1392  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  69.01 
 
 
285 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0651  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  59.51 
 
 
303 aa  332  6e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00254514  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3374  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  59.42 
 
 
287 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2205  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  61.4 
 
 
294 aa  295  5e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0096  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  45.88 
 
 
285 aa  242  6e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  46.52 
 
 
288 aa  241  7.999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0176  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  46.26 
 
 
286 aa  218  8.999999999999998e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0715636  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1088  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  44.03 
 
 
284 aa  217  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0563652  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2388  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.12 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306171  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1451  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  44.4 
 
 
294 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0139046  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2196  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  43.17 
 
 
284 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1642  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  40.78 
 
 
288 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000163597  hitchhiker  0.000177329 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0216  prenyltransferase  43.42 
 
 
289 aa  209  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3612  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  44.89 
 
 
287 aa  208  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0678  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  42.5 
 
 
282 aa  208  8e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0184181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0232  prenyltransferase  43.06 
 
 
289 aa  206  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3393  prenyltransferase  44.53 
 
 
298 aa  202  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.604924  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0290  prenyltransferase  42.6 
 
 
294 aa  201  9e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1811  prenyltransferase  40.38 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0439  prenyltransferase  44.49 
 
 
298 aa  199  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14810  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.93 
 
 
287 aa  198  7e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0818  prenyltransferase  41.79 
 
 
289 aa  198  9e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00247672  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0160  prenyltransferase  40.07 
 
 
294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.579339  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0154  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.59 
 
 
289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.383196  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1429  prenyltransferase  40.66 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0200  prenyltransferase  40.43 
 
 
294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4093  prenyltransferase  43.68 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0975  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.86 
 
 
288 aa  195  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1490  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  35.46 
 
 
285 aa  194  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512063  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0179  prenyltransferase  39.36 
 
 
294 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4513  prenyltransferase  44.8 
 
 
316 aa  192  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0256  prenyltransferase  43.87 
 
 
314 aa  192  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.991703  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0516  prenyltransferase  43.01 
 
 
319 aa  192  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0397  prenyltransferase  40.14 
 
 
288 aa  192  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0578839  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1159  prenyltransferase  42.59 
 
 
286 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.848518  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0823  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  39.87 
 
 
311 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167929  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6114  prenyltransferase  41.79 
 
 
315 aa  185  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8072  prenyltransferase  42.81 
 
 
315 aa  185  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0316  prenyltransferase  42.2 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.65204e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3757  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  41.61 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.987764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4282  prenyltransferase  42.66 
 
 
290 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3210  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  39.48 
 
 
290 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0129824  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0218  prenyltransferase  39.01 
 
 
289 aa  178  9e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0288  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  42.24 
 
 
294 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1038  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  36.36 
 
 
283 aa  171  9e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0379188  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2322  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  41.26 
 
 
319 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1902  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.37 
 
 
288 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0324  prenyltransferase  38.21 
 
 
290 aa  160  2e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4209  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  43.48 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102097  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1101  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.77 
 
 
302 aa  122  8e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0397  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  41.71 
 
 
286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0369  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  42.18 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.1864  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0609  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  35.05 
 
 
289 aa  117  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000295673 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0398  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.65 
 
 
286 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.967191  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1512  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.46 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.378404  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1574  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  39.5 
 
 
284 aa  112  5e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000853939 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2096  prenyltransferase  33.05 
 
 
301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0492  prenyltransferase  30.64 
 
 
302 aa  103  3e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.203515  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1703  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  38.89 
 
 
291 aa  102  8e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00297592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0824  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  31.51 
 
 
316 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129328  normal  0.188314 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5382  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  31.78 
 
 
315 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0897  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.56 
 
 
316 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.841681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0857  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  31.02 
 
 
316 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  0.0717039 
 
 
-
 
NC_002978  WD1316  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  24.8 
 
 
285 aa  87.4  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0054  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.59 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0138918  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1486  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.67 
 
 
323 aa  86.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3595  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.27 
 
 
294 aa  86.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0415  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.18 
 
 
333 aa  85.9  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.638328  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0530  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.89 
 
 
342 aa  85.9  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0423  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.18 
 
 
333 aa  85.5  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0477  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  26.64 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.036458  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0824  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.13 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.69 
 
 
327 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884391  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4497  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.23 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0633254  normal  0.801833 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0572  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.29 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0126  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.69 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2939  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.15 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105208  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0359  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  31.55 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0965  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.24 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291497  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2235  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.05 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396167  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2611  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.75 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2242  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.43 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161833  normal  0.0898347 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3384  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.27 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0363  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.7 
 
 
324 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2803  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.94 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3527  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.11 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2562  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  26.91 
 
 
307 aa  79  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1286  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.57 
 
 
310 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1613  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0142555 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3808  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.48 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.466325  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0511  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25.45 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00072  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.17 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6135  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.17 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1089  UbiA prenyltransferase  30.09 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1685  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.85 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3815  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.71 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0697  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.72 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370156  normal  0.206083 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0469  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.8 
 
 
288 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>