More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1088 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1088  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  100 
 
 
284 aa  562  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0563652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1642  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  61.7 
 
 
288 aa  358  4e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000163597  hitchhiker  0.000177329 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2196  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  60.07 
 
 
284 aa  342  5e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1451  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  57.8 
 
 
294 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0139046  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0096  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  57.25 
 
 
285 aa  311  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2388  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50.18 
 
 
283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306171  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0176  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  53.41 
 
 
286 aa  271  6e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0715636  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0439  prenyltransferase  46.81 
 
 
298 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0678  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  47.52 
 
 
282 aa  248  6e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0184181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3393  prenyltransferase  45.39 
 
 
298 aa  248  7e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.604924  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  46.32 
 
 
288 aa  242  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14810  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  44.13 
 
 
287 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4282  prenyltransferase  47.52 
 
 
290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0232  prenyltransferase  44.77 
 
 
289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0216  prenyltransferase  45.13 
 
 
289 aa  232  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0397  prenyltransferase  43.46 
 
 
288 aa  227  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0578839  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3612  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  44 
 
 
287 aa  223  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0290  prenyltransferase  43.73 
 
 
294 aa  221  7e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2322  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  49.47 
 
 
319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1337  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  44.03 
 
 
286 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3374  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  41.99 
 
 
287 aa  215  7e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1392  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  43.35 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3210  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  40.35 
 
 
290 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0129824  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2015  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  41.95 
 
 
287 aa  206  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3757  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  43.26 
 
 
298 aa  204  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.987764  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0256  prenyltransferase  43.84 
 
 
314 aa  203  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.991703  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1490  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  36.04 
 
 
285 aa  201  9e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512063  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0975  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  40.38 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4513  prenyltransferase  43.01 
 
 
316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0823  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.71 
 
 
311 aa  198  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167929  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8072  prenyltransferase  41.73 
 
 
315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6114  prenyltransferase  42.03 
 
 
315 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4093  prenyltransferase  42.49 
 
 
316 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0516  prenyltransferase  41.43 
 
 
319 aa  189  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2205  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  40.93 
 
 
294 aa  187  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0651  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.11 
 
 
303 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00254514  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0316  prenyltransferase  45.85 
 
 
294 aa  182  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.65204e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1902  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  36.71 
 
 
288 aa  175  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0288  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  40.49 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1159  prenyltransferase  37.37 
 
 
286 aa  169  4e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.848518  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1811  prenyltransferase  39.05 
 
 
286 aa  169  6e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1429  prenyltransferase  35.79 
 
 
291 aa  167  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1038  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  35.23 
 
 
283 aa  165  5.9999999999999996e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0379188  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0818  prenyltransferase  35.54 
 
 
289 aa  159  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00247672  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0218  prenyltransferase  36.04 
 
 
289 aa  154  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0200  prenyltransferase  35.89 
 
 
294 aa  152  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0154  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  34.27 
 
 
289 aa  151  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.383196  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0369  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  44.25 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.1864  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0179  prenyltransferase  34.84 
 
 
294 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0160  prenyltransferase  34.84 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.579339  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0397  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  45.83 
 
 
286 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4209  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  43.54 
 
 
301 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102097  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0398  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  44.91 
 
 
286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.967191  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0324  prenyltransferase  32.04 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0609  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  36.43 
 
 
289 aa  113  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000295673 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1512  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  39.39 
 
 
293 aa  105  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.378404  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1574  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  37.12 
 
 
284 aa  105  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000853939 
 
 
-
 
NC_002620  TC0492  prenyltransferase  32.02 
 
 
302 aa  102  9e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.203515  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2096  prenyltransferase  32.91 
 
 
301 aa  93.6  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1101  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.61 
 
 
302 aa  91.7  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1703  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  34.98 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00297592 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0581  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.43 
 
 
292 aa  85.5  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00583623  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0477  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.45 
 
 
321 aa  79  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.036458  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0441  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  25 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.351552  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0543  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.8 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00391921  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3733  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.9 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000311091  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2519  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  26.84 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  0.917266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0359  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.52 
 
 
312 aa  75.5  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3679  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.47 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3913  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  35.76 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3837  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.8 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0373903  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0530  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.92 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0588  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.262938 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0054  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.57 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0138918  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2611  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.12 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1217  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.89 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.45215  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2421  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  31.63 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.755837  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0415  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.54 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.638328  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1964  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.91 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.855973  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0423  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.54 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0245  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.84 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2242  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  32.68 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161833  normal  0.0898347 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0729  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.84 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.262552  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2657  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.7 
 
 
287 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0502298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3595  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  28.15 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2895  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.46 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2362  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.47 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.620404  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2271  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  35.14 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.872623  normal  0.993319 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0697  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.84 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370156  normal  0.206083 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02871  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  31.86 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0653  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  31.25 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.110294  normal  0.440734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0824  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.67 
 
 
316 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129328  normal  0.188314 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0582  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  26.27 
 
 
295 aa  68.9  0.00000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00112694  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3815  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.18 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3983  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.27 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0645  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.98 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0619  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.98 
 
 
290 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1316  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  23.43 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3384  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.04 
 
 
286 aa  67  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2939  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.22 
 
 
294 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105208  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>