More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2015 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2015  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  100 
 
 
287 aa  564  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1337  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  68.53 
 
 
286 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1392  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  70.53 
 
 
285 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0651  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  64.21 
 
 
303 aa  355  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00254514  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3374  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  64.21 
 
 
287 aa  332  3e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2205  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  61.62 
 
 
294 aa  298  5e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  46.35 
 
 
288 aa  240  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0096  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  43.18 
 
 
285 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1642  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.12 
 
 
288 aa  221  8e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000163597  hitchhiker  0.000177329 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3393  prenyltransferase  45.68 
 
 
298 aa  216  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.604924  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0216  prenyltransferase  44.04 
 
 
289 aa  215  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0232  prenyltransferase  43.6 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1490  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  39.64 
 
 
285 aa  211  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512063  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2388  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  44.49 
 
 
283 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306171  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2196  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  43.61 
 
 
284 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1451  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  44.36 
 
 
294 aa  210  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0139046  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0678  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  40.88 
 
 
282 aa  209  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0184181  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1429  prenyltransferase  44.12 
 
 
291 aa  207  2e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0397  prenyltransferase  41.16 
 
 
288 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0578839  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0176  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  45.45 
 
 
286 aa  206  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0715636  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1088  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  41.95 
 
 
284 aa  206  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0563652  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0290  prenyltransferase  41.3 
 
 
294 aa  205  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0439  prenyltransferase  43.6 
 
 
298 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0200  prenyltransferase  42.55 
 
 
294 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0975  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  41.92 
 
 
288 aa  204  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0160  prenyltransferase  41.45 
 
 
294 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.579339  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0179  prenyltransferase  41.45 
 
 
294 aa  200  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0256  prenyltransferase  41.82 
 
 
314 aa  199  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.991703  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0516  prenyltransferase  41.45 
 
 
319 aa  199  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3612  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  40.78 
 
 
287 aa  199  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4093  prenyltransferase  43.32 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0818  prenyltransferase  44.32 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00247672  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4513  prenyltransferase  44.24 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0823  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  41.67 
 
 
311 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167929  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1159  prenyltransferase  43.75 
 
 
286 aa  194  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.848518  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0154  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.86 
 
 
289 aa  192  6e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.383196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3210  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  39.07 
 
 
290 aa  192  7e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0129824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8072  prenyltransferase  43.12 
 
 
315 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0288  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  44.32 
 
 
294 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1811  prenyltransferase  39.64 
 
 
286 aa  189  4e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0316  prenyltransferase  41.88 
 
 
294 aa  188  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.65204e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0218  prenyltransferase  42.49 
 
 
289 aa  188  1e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6114  prenyltransferase  39.86 
 
 
315 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1902  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.6 
 
 
288 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14810  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  37.73 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4282  prenyltransferase  42.14 
 
 
290 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0324  prenyltransferase  41.54 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1038  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  37.45 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0379188  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3757  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  39.47 
 
 
298 aa  168  9e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.987764  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2322  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  42.6 
 
 
319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4209  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  43.26 
 
 
301 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102097  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0609  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  32.35 
 
 
289 aa  123  3e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000295673 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1574  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  34.16 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000853939 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1101  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.53 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0397  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  39.35 
 
 
286 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0369  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  38.89 
 
 
286 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.1864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0398  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.89 
 
 
286 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.967191  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1512  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  33.62 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.378404  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1703  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  34.28 
 
 
291 aa  108  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00297592 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2096  prenyltransferase  29.9 
 
 
301 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0492  prenyltransferase  31.29 
 
 
302 aa  106  4e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.203515  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1486  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.86 
 
 
323 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0824  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  31.23 
 
 
316 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129328  normal  0.188314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0897  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  32.62 
 
 
316 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.841681 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0581  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.62 
 
 
292 aa  101  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00583623  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0857  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  32.62 
 
 
316 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  0.0717039 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0477  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.93 
 
 
321 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.036458  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0530  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  35.45 
 
 
342 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0415  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  34.73 
 
 
333 aa  96.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.638328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0423  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  34.73 
 
 
333 aa  96.3  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0359  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.89 
 
 
312 aa  95.5  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  34.62 
 
 
327 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884391  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0965  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.8 
 
 
317 aa  92  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291497  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3815  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  31.14 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2562  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.32 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0645  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.04 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0543  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  35.19 
 
 
319 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00391921  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0697  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.04 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370156  normal  0.206083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0619  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.04 
 
 
290 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0588  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.92 
 
 
322 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.262938 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0245  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.04 
 
 
287 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0729  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.04 
 
 
287 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.262552  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2657  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.88 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0502298 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0441  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  26.89 
 
 
291 aa  87  3e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.351552  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0159  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.63 
 
 
286 aa  86.7  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.383363  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4280  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.16 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1786  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.6 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0067  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  28.63 
 
 
273 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.209668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1685  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.57 
 
 
310 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3837  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.18 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0373903  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2904  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.05 
 
 
329 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.520314 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03912  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.27 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3953  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.27 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4502  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.27 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4557  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.27 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0393  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.05 
 
 
334 aa  84  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.275276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4593  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.27 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.568331  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03872  hypothetical protein  27.27 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5521  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.27 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.272125  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3988  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.27 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.370593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>