More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2388 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2388  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  100 
 
 
283 aa  565  1e-160  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306171  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0176  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  77.3 
 
 
286 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0715636  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2196  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  52.38 
 
 
284 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14810  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50 
 
 
287 aa  277  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1088  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  50.18 
 
 
284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0563652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1642  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  48.89 
 
 
288 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000163597  hitchhiker  0.000177329 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2322  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  56.45 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0096  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  48.53 
 
 
285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1451  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  48.75 
 
 
294 aa  248  9e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0139046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0232  prenyltransferase  47.21 
 
 
289 aa  235  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  44.07 
 
 
288 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3374  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  47.71 
 
 
287 aa  231  9e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0439  prenyltransferase  47.48 
 
 
298 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3393  prenyltransferase  45.09 
 
 
298 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.604924  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0216  prenyltransferase  46.47 
 
 
289 aa  229  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0678  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  47.54 
 
 
282 aa  225  7e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0184181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4282  prenyltransferase  46.59 
 
 
290 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1490  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  41.35 
 
 
285 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512063  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0290  prenyltransferase  44.8 
 
 
294 aa  221  8e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0397  prenyltransferase  44.29 
 
 
288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0578839  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3612  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  44.4 
 
 
287 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1337  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.12 
 
 
286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2015  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  44.49 
 
 
287 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1392  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  41.83 
 
 
285 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0975  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  41.61 
 
 
288 aa  206  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0256  prenyltransferase  45.13 
 
 
314 aa  206  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.991703  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2205  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  43.57 
 
 
294 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0823  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  41.41 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167929  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3757  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.96 
 
 
298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.987764  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4513  prenyltransferase  43.06 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4093  prenyltransferase  44.93 
 
 
316 aa  195  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0516  prenyltransferase  43.07 
 
 
319 aa  191  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1902  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  40.88 
 
 
288 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8072  prenyltransferase  42.66 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3210  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  38.19 
 
 
290 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0129824  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6114  prenyltransferase  41.09 
 
 
315 aa  181  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0651  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  37.01 
 
 
303 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00254514  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1811  prenyltransferase  36.43 
 
 
286 aa  177  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1429  prenyltransferase  36.75 
 
 
291 aa  177  2e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0316  prenyltransferase  43.33 
 
 
294 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.65204e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1038  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  37.1 
 
 
283 aa  169  7e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0379188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0288  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  41.39 
 
 
294 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1159  prenyltransferase  36.16 
 
 
286 aa  163  3e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.848518  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0818  prenyltransferase  37.17 
 
 
289 aa  158  9e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00247672  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0218  prenyltransferase  35.92 
 
 
289 aa  158  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0200  prenyltransferase  34.32 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0179  prenyltransferase  33.95 
 
 
294 aa  152  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0160  prenyltransferase  33.95 
 
 
294 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.579339  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0154  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  34.69 
 
 
289 aa  149  5e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.383196  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0324  prenyltransferase  34.89 
 
 
290 aa  143  4e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0369  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  41.01 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.1864  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4209  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  41.26 
 
 
301 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102097  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0397  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.89 
 
 
286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0398  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.89 
 
 
286 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.967191  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0492  prenyltransferase  30.96 
 
 
302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.203515  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0609  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  36.71 
 
 
289 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000295673 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1101  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.72 
 
 
302 aa  105  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2096  prenyltransferase  28.06 
 
 
301 aa  104  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1512  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  39.71 
 
 
293 aa  98.2  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.378404  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1574  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  37.09 
 
 
284 aa  95.9  7e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000853939 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00272  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.86 
 
 
284 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002146  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  26.79 
 
 
284 aa  89.4  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4497  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.21 
 
 
286 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0633254  normal  0.801833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0469  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.37 
 
 
288 aa  86.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.59 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0581  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  24.48 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00583623  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03912  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.71 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4557  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.71 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3953  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.71 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03872  hypothetical protein  29.71 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4502  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.71 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4593  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.71 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.568331  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0572  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.65 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3988  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.71 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0965  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.6 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271339  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5521  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.71 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.272125  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1703  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  37.56 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00297592 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3384  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.88 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.67 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0054  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.04 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0138918  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4280  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.29 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1316  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  26.21 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2611  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.15 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3837  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.74 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0373903  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0824  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.47 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129328  normal  0.188314 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0824  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.31 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5382  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  32.73 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2421  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.78 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.755837  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2242  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.97 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161833  normal  0.0898347 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2895  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.45 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0857  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.57 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  0.0717039 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3733  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.88 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000311091  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0897  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.17 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.841681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0359  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  26.8 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2283  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.89 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3679  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.48 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4628  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.13 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.133714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4491  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.13 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4577  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.13 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677427  normal  0.0427983 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4576  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.13 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>