259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1703 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1703  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  100 
 
 
291 aa  566  1e-160  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00297592 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0609  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  71.43 
 
 
289 aa  415  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000295673 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1574  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  73.5 
 
 
284 aa  393  1e-108  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000853939 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1512  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  72.82 
 
 
293 aa  389  1e-107  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.378404  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1101  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  33.56 
 
 
302 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2096  prenyltransferase  34.8 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0651  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.61 
 
 
303 aa  132  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00254514  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2015  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  34.63 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0516  prenyltransferase  38.46 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6114  prenyltransferase  40.45 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3210  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  33.57 
 
 
290 aa  126  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0129824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1642  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  36.94 
 
 
288 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000163597  hitchhiker  0.000177329 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3374  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.94 
 
 
287 aa  122  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8072  prenyltransferase  37.99 
 
 
315 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1337  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.61 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1490  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  35.82 
 
 
285 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512063  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1038  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  34.62 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0379188  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0256  prenyltransferase  40 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.991703  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2196  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  34.16 
 
 
284 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0823  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  34.56 
 
 
311 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167929  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0096  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  40.3 
 
 
285 aa  115  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1392  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.13 
 
 
285 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2205  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  37.45 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4093  prenyltransferase  38.29 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14810  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  40 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4513  prenyltransferase  38.73 
 
 
316 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1451  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  34.44 
 
 
294 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0139046  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3393  prenyltransferase  36.1 
 
 
298 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.604924  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1088  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  35.8 
 
 
284 aa  106  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0563652  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0216  prenyltransferase  35.47 
 
 
289 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4282  prenyltransferase  35.04 
 
 
290 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0439  prenyltransferase  35.09 
 
 
298 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0678  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  35.75 
 
 
282 aa  102  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0184181  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2388  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.28 
 
 
283 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306171  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  35.68 
 
 
288 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4209  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  37.38 
 
 
301 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102097  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0232  prenyltransferase  37.02 
 
 
289 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0288  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  33.93 
 
 
294 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0397  prenyltransferase  32.89 
 
 
288 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0578839  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0290  prenyltransferase  33.47 
 
 
294 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0818  prenyltransferase  32.02 
 
 
289 aa  99  8e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00247672  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3757  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  35.65 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.987764  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0200  prenyltransferase  29.89 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0179  prenyltransferase  30.2 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0160  prenyltransferase  30.2 
 
 
294 aa  96.7  4e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.579339  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0975  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.54 
 
 
288 aa  96.3  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0176  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  37.07 
 
 
286 aa  96.3  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0715636  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1159  prenyltransferase  30 
 
 
286 aa  90.5  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.848518  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1811  prenyltransferase  31.31 
 
 
286 aa  90.5  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0316  prenyltransferase  34.88 
 
 
294 aa  89  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.65204e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1429  prenyltransferase  30.92 
 
 
291 aa  88.2  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3612  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  33.91 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1902  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.07 
 
 
288 aa  86.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0154  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.2 
 
 
289 aa  86.3  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.383196  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4114  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.59 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0492  prenyltransferase  34.43 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.203515  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0369  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  41.06 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.1864  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0324  prenyltransferase  30.48 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0397  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.38 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0218  prenyltransferase  27.62 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4711  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.95 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3733  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.52 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000311091  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0477  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  34.19 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.036458  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3184  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.84 
 
 
313 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934853  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3679  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.19 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0625  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.84 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1344  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.37 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.256325  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0824  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  32.8 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129328  normal  0.188314 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0067  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.53 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.209668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.26 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884391  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0588  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.4 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.262938 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2322  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  31.43 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0543  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.88 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00391921  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1685  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.88 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3100  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.14 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2242  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.48 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161833  normal  0.0898347 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5031  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.14 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2283  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  34.81 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642168 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2562  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.77 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1849  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.5 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000654272 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0965  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  33.73 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291497  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3080  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  31.58 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0398  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  41.72 
 
 
286 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.967191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5476  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  32.97 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1008  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0128  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  34.81 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0530  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.38 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0415  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  31.93 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.638328  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4497  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.64 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0633254  normal  0.801833 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.52 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70730  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  34.38 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0423  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  31.93 
 
 
333 aa  68.9  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2668  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.6 
 
 
333 aa  68.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.305023  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48510  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  32.29 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.826372  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0469  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.7 
 
 
288 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6135  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  32.24 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4399  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  32.2 
 
 
284 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02871  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  31.69 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1486  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.38 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0897  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  31.21 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.841681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>