More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3184 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3184  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  100 
 
 
313 aa  608  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934853  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2562  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  85.99 
 
 
307 aa  528  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4114  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  73.7 
 
 
316 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1344  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  75.08 
 
 
316 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.256325  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4711  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  77.99 
 
 
310 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1685  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  76.37 
 
 
310 aa  447  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1849  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  72.22 
 
 
316 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000654272 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1486  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  61.36 
 
 
323 aa  340  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0653  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  55.37 
 
 
340 aa  321  9.000000000000001e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.110294  normal  0.440734 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0530  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  55.77 
 
 
342 aa  315  6e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0543  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  54.66 
 
 
319 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00391921  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0824  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  61.69 
 
 
316 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129328  normal  0.188314 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0588  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  54.02 
 
 
322 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.262938 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0393  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50.8 
 
 
334 aa  305  7e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.275276  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3913  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  55.88 
 
 
318 aa  300  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0897  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  60.98 
 
 
316 aa  300  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.841681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0363  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  62.25 
 
 
324 aa  299  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5382  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  59.41 
 
 
315 aa  299  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3100  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  56.61 
 
 
322 aa  295  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2246  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  59.94 
 
 
326 aa  295  8e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0326669  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0572  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  54.52 
 
 
307 aa  294  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2668  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  55.33 
 
 
333 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.305023  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1008  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  55 
 
 
333 aa  292  5e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0415  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  54.02 
 
 
333 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.638328  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0857  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  60.06 
 
 
316 aa  290  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  0.0717039 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2242  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.57 
 
 
308 aa  288  6e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161833  normal  0.0898347 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0423  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  53.38 
 
 
333 aa  287  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0625  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  53.82 
 
 
323 aa  286  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2904  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  56.91 
 
 
329 aa  285  8e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.520314 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0965  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50.81 
 
 
317 aa  282  6.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291497  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  57.33 
 
 
327 aa  280  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884391  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0217  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  53.95 
 
 
330 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0477  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  51.94 
 
 
321 aa  279  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.036458  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3080  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50.33 
 
 
320 aa  275  6e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43450  predicted protein  47.51 
 
 
404 aa  262  6.999999999999999e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0229957  normal  0.0842835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2247  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  53.55 
 
 
322 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0799329  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2235  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  44.97 
 
 
304 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396167  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0359  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  49.32 
 
 
312 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01780  prenyltransferase, putative  44.22 
 
 
373 aa  228  1e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.451641  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12269  predicted protein  44.15 
 
 
300 aa  227  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3112  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  48.63 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2271  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  49.29 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.872623  normal  0.993319 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0951  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  45.7 
 
 
304 aa  208  9e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2362  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  49.83 
 
 
328 aa  207  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.620404  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1877  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  50.89 
 
 
286 aa  206  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218017  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3384  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.01 
 
 
286 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4497  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.27 
 
 
286 aa  189  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0633254  normal  0.801833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5031  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.72 
 
 
296 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.77 
 
 
286 aa  186  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_87025  Para-hydroxybenzoate--polyprenyltransferase, mitochondrial precursor (PHB:polyprenyltransferase)  40.89 
 
 
285 aa  185  7e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0469  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.37 
 
 
288 aa  185  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5476  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  38.11 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0442  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.36 
 
 
286 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1316  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  39.41 
 
 
285 aa  181  2e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3891  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.72 
 
 
286 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3817  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.72 
 
 
286 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4014  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.72 
 
 
286 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.36 
 
 
286 aa  179  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3252  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  40.57 
 
 
298 aa  180  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3372  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.5 
 
 
286 aa  176  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.962775  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3837  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.37 
 
 
299 aa  177  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0373903  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0965  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.86 
 
 
299 aa  176  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271339  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4399  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  36.27 
 
 
284 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0474  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.15 
 
 
286 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3557  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.15 
 
 
286 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.393254  normal  0.712542 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.63 
 
 
286 aa  176  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0470  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.85 
 
 
286 aa  175  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.517028  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2048  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  36.2 
 
 
287 aa  175  9e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0140  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  36.2 
 
 
287 aa  175  9e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.654949  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6135  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  40.35 
 
 
296 aa  175  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0420  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.86 
 
 
290 aa  172  9e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5604  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.57 
 
 
296 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70730  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.72 
 
 
296 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0126  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  35.27 
 
 
287 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3773  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.22 
 
 
288 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3863  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.22 
 
 
288 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.508575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0679  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.22 
 
 
288 aa  169  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48510  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.07 
 
 
295 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.826372  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3469  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  37.77 
 
 
287 aa  169  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.689102  normal  0.729322 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0044  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.23 
 
 
299 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00272  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.11 
 
 
284 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0156  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.5 
 
 
296 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0053  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.23 
 
 
299 aa  166  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0716312  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0511  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.96 
 
 
287 aa  166  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02871  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.21 
 
 
299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2161  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  35.21 
 
 
285 aa  165  8e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3595  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  35.87 
 
 
294 aa  165  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3527  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.04 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0483  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.3 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0054  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.93 
 
 
296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0138918  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0730  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.87 
 
 
287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002146  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  33.8 
 
 
284 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3953  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  36.69 
 
 
290 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4557  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.69 
 
 
290 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4502  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.69 
 
 
290 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03872  hypothetical protein  36.69 
 
 
290 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00072  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.87 
 
 
286 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4280  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.69 
 
 
290 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5521  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.69 
 
 
290 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.272125  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3988  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.69 
 
 
290 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.370593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>