More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0975 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0975  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  100 
 
 
288 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1902  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  59.93 
 
 
288 aa  325  4.0000000000000003e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2196  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  44.88 
 
 
284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3393  prenyltransferase  43.94 
 
 
298 aa  229  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.604924  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0397  prenyltransferase  43.57 
 
 
288 aa  226  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0578839  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0232  prenyltransferase  43.21 
 
 
289 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3757  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  44.49 
 
 
298 aa  223  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.987764  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1490  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  43.11 
 
 
285 aa  223  4e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512063  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0216  prenyltransferase  42.91 
 
 
289 aa  221  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0439  prenyltransferase  42.14 
 
 
298 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0290  prenyltransferase  41.7 
 
 
294 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0256  prenyltransferase  42.66 
 
 
314 aa  217  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.991703  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0678  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  41.84 
 
 
282 aa  216  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0184181  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8072  prenyltransferase  43.66 
 
 
315 aa  215  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  45.63 
 
 
288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0096  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  40.29 
 
 
285 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1642  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  40.29 
 
 
288 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000163597  hitchhiker  0.000177329 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14810  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  41.75 
 
 
287 aa  208  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2388  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  41.61 
 
 
283 aa  206  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306171  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3210  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  41.42 
 
 
290 aa  206  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0129824  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2015  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  41.92 
 
 
287 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3612  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  43.07 
 
 
287 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3374  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.25 
 
 
287 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1811  prenyltransferase  40.78 
 
 
286 aa  203  3e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1088  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  40.38 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0563652  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4513  prenyltransferase  40.3 
 
 
316 aa  198  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1392  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  41.54 
 
 
285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4093  prenyltransferase  39.93 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0516  prenyltransferase  38.46 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4282  prenyltransferase  41.58 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6114  prenyltransferase  38.58 
 
 
315 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0316  prenyltransferase  42.65 
 
 
294 aa  195  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.65204e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1337  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.86 
 
 
286 aa  195  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0176  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.2 
 
 
286 aa  195  8.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0715636  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0823  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  35.06 
 
 
311 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167929  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1429  prenyltransferase  39.3 
 
 
291 aa  192  7e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0218  prenyltransferase  41.13 
 
 
289 aa  190  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1451  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  40.43 
 
 
294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0139046  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0651  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  40.23 
 
 
303 aa  189  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00254514  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1159  prenyltransferase  40.43 
 
 
286 aa  188  1e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.848518  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0818  prenyltransferase  40.57 
 
 
289 aa  183  3e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00247672  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1038  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  36.4 
 
 
283 aa  183  3e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0379188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0288  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  43.57 
 
 
294 aa  183  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0200  prenyltransferase  39.78 
 
 
294 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0154  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  39.36 
 
 
289 aa  176  6e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.383196  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0160  prenyltransferase  39.05 
 
 
294 aa  175  8e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.579339  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0179  prenyltransferase  39.05 
 
 
294 aa  175  8e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0324  prenyltransferase  36.23 
 
 
290 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2322  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  39.51 
 
 
319 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2205  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  37.41 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0369  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  36.68 
 
 
286 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.1864  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4209  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  43.69 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102097  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0397  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  37.04 
 
 
286 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0398  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  37.04 
 
 
286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.967191  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0609  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  35.53 
 
 
289 aa  109  6e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000295673 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2096  prenyltransferase  32.35 
 
 
301 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0492  prenyltransferase  38.66 
 
 
302 aa  104  2e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.203515  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1512  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  34.76 
 
 
293 aa  102  6e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.378404  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1101  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  31.12 
 
 
302 aa  102  8e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1574  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  33.94 
 
 
284 aa  100  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000853939 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0530  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.56 
 
 
342 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5382  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  28.17 
 
 
315 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_004310  BR0415  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  31.11 
 
 
333 aa  93.6  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.638328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0423  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  31.11 
 
 
333 aa  93.6  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2562  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  25.93 
 
 
307 aa  93.6  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4114  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.8 
 
 
316 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00272  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.78 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0824  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.12 
 
 
316 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129328  normal  0.188314 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0965  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.93 
 
 
299 aa  90.1  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271339  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0477  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  26.91 
 
 
321 aa  89.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.036458  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0469  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.83 
 
 
288 aa  89.4  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002146  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  26.1 
 
 
284 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0653  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.33 
 
 
340 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.110294  normal  0.440734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1344  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.42 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.256325  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4711  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.09 
 
 
310 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4497  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  32.63 
 
 
286 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0633254  normal  0.801833 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0588  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  24.79 
 
 
322 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.262938 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2895  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.63 
 
 
285 aa  86.3  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2247  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.76 
 
 
322 aa  86.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0799329  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0543  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  25.21 
 
 
319 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00391921  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0897  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.48 
 
 
316 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.841681 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2904  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  33.78 
 
 
329 aa  85.9  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.520314 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  31.36 
 
 
286 aa  85.9  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2611  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.1 
 
 
290 aa  85.5  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1849  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.51 
 
 
316 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000654272 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3595  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.66 
 
 
294 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0857  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  28.8 
 
 
316 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  0.0717039 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3184  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  25.46 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934853  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2246  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  25.38 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0326669  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.29 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5604  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.46 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0965  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.93 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291497  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3384  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  31.09 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3469  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.7 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.689102  normal  0.729322 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00072  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.63 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0619  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.07 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0140  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.96 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.654949  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1685  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.13 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2519  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.79 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  0.917266 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3080  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.47 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>