More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0897 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0897  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  100 
 
 
316 aa  618  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.841681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0857  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  98.73 
 
 
316 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  0.0717039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0824  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  93.99 
 
 
316 aa  542  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129328  normal  0.188314 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5382  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  74.27 
 
 
315 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0363  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  73.08 
 
 
324 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2246  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  70.44 
 
 
326 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0326669  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1486  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  59.42 
 
 
323 aa  338  9e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4114  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  58.77 
 
 
316 aa  338  9e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2562  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  58.5 
 
 
307 aa  329  4e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1685  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  61.32 
 
 
310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1344  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  57.14 
 
 
316 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.256325  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1849  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  57.14 
 
 
316 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000654272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4711  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  59.52 
 
 
310 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3184  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  59.59 
 
 
313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934853  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0653  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  55.16 
 
 
340 aa  295  5e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.110294  normal  0.440734 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0530  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  53.33 
 
 
342 aa  295  8e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0477  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  51.27 
 
 
321 aa  289  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.036458  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0588  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  52.15 
 
 
322 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.262938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0543  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  51.49 
 
 
319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00391921  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_004310  BR0415  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  52.7 
 
 
333 aa  282  4.0000000000000003e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.638328  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2247  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  58.28 
 
 
322 aa  282  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0799329  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2904  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  57.28 
 
 
329 aa  280  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.520314 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0423  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  52.38 
 
 
333 aa  280  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  56.45 
 
 
327 aa  279  5e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884391  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0393  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  44.06 
 
 
334 aa  270  2e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.275276  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1008  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50.99 
 
 
333 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2668  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50.99 
 
 
333 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.305023  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0965  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  46.47 
 
 
317 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291497  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3913  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  49.08 
 
 
318 aa  259  5.0000000000000005e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3080  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  48.11 
 
 
320 aa  258  7e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2242  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  49.83 
 
 
308 aa  253  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161833  normal  0.0898347 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3100  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50.33 
 
 
322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0625  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50.48 
 
 
323 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0217  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  48.71 
 
 
330 aa  245  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0572  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.17 
 
 
307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0359  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  47.28 
 
 
312 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2271  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50.89 
 
 
302 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.872623  normal  0.993319 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43450  predicted protein  46.08 
 
 
404 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0229957  normal  0.0842835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2235  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.59 
 
 
304 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396167  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0951  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50.37 
 
 
304 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12269  predicted protein  45.12 
 
 
300 aa  204  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01780  prenyltransferase, putative  43.61 
 
 
373 aa  203  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.451641  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2362  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  49.47 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.620404  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3384  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  41.43 
 
 
286 aa  195  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3112  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  45.14 
 
 
305 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4497  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  40.71 
 
 
286 aa  189  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0633254  normal  0.801833 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4014  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  42.5 
 
 
286 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0442  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  42.5 
 
 
286 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3817  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  42.5 
 
 
286 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3891  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  42.5 
 
 
286 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0469  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.79 
 
 
288 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1877  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  51.26 
 
 
286 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  40.71 
 
 
286 aa  186  5e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.94 
 
 
286 aa  180  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  40.57 
 
 
286 aa  178  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4399  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  39.01 
 
 
284 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0420  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.21 
 
 
290 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0474  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  41.28 
 
 
286 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3557  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  41.28 
 
 
286 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.393254  normal  0.712542 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0470  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  40.93 
 
 
286 aa  169  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.517028  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3372  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  40.71 
 
 
286 aa  168  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.962775  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5604  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.9 
 
 
296 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70730  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.93 
 
 
296 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5476  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  39.38 
 
 
296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3252  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.13 
 
 
298 aa  166  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2519  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  38.99 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  0.917266 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3401  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  40.57 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5031  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.97 
 
 
296 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4280  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  41.22 
 
 
290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03912  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  41.22 
 
 
290 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3953  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  41.22 
 
 
290 aa  162  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3988  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  41.22 
 
 
290 aa  162  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4557  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  41.22 
 
 
290 aa  162  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03872  hypothetical protein  41.22 
 
 
290 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4502  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  41.22 
 
 
290 aa  162  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4593  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  41.22 
 
 
290 aa  162  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.568331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5521  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  41.22 
 
 
290 aa  162  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.272125  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1286  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.29 
 
 
310 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0483  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.57 
 
 
302 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1173  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.15 
 
 
370 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0312  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.15 
 
 
370 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2582  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.15 
 
 
287 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.15 
 
 
316 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.38401  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3773  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  40.14 
 
 
288 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0511  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.82 
 
 
287 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3361  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.15 
 
 
316 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230126  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_87025  Para-hydroxybenzoate--polyprenyltransferase, mitochondrial precursor (PHB:polyprenyltransferase)  38.89 
 
 
285 aa  160  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6135  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.93 
 
 
296 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2657  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.81 
 
 
287 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0502298 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00272  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.08 
 
 
284 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0679  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.78 
 
 
288 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0965  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.21 
 
 
299 aa  160  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271339  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3815  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.51 
 
 
287 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3863  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.78 
 
 
288 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.508575  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4409  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.28 
 
 
296 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0458215 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3316  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.79 
 
 
287 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3350  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.79 
 
 
287 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0245  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.46 
 
 
287 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48510  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.42 
 
 
295 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.826372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0729  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.46 
 
 
287 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.262552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>