More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3374 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3374  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  100 
 
 
287 aa  566  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2015  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  64.21 
 
 
287 aa  332  3e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1337  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  59.42 
 
 
286 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1392  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  61.76 
 
 
285 aa  311  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2205  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  58.25 
 
 
294 aa  293  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0651  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  53.43 
 
 
303 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00254514  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1642  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  44.96 
 
 
288 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000163597  hitchhiker  0.000177329 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2388  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  47.71 
 
 
283 aa  231  9e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306171  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0216  prenyltransferase  44.15 
 
 
289 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1451  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  45.42 
 
 
294 aa  225  7e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0139046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0232  prenyltransferase  44.15 
 
 
289 aa  225  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0096  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.44 
 
 
285 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3393  prenyltransferase  45.52 
 
 
298 aa  223  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.604924  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1811  prenyltransferase  43.07 
 
 
286 aa  221  9e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0176  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  48.21 
 
 
286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0715636  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0439  prenyltransferase  43.66 
 
 
298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0823  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  44.3 
 
 
311 aa  215  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167929  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1088  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  41.99 
 
 
284 aa  215  7e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0563652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  44.17 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0516  prenyltransferase  46.04 
 
 
319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2196  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  42.96 
 
 
284 aa  212  7e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1429  prenyltransferase  44.07 
 
 
291 aa  211  7.999999999999999e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0397  prenyltransferase  42.05 
 
 
288 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0578839  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14810  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  41.61 
 
 
287 aa  209  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0678  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  44.77 
 
 
282 aa  209  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0184181  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6114  prenyltransferase  44.76 
 
 
315 aa  208  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0290  prenyltransferase  41.99 
 
 
294 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0256  prenyltransferase  47.96 
 
 
314 aa  206  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.991703  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8072  prenyltransferase  43.17 
 
 
315 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0975  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.25 
 
 
288 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1159  prenyltransferase  43.57 
 
 
286 aa  203  3e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.848518  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1490  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.2 
 
 
285 aa  201  9e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512063  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0818  prenyltransferase  40.07 
 
 
289 aa  199  3e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00247672  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3612  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  46.07 
 
 
287 aa  198  7e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0200  prenyltransferase  39.86 
 
 
294 aa  196  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0160  prenyltransferase  39.5 
 
 
294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.579339  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4093  prenyltransferase  46.1 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4513  prenyltransferase  46.67 
 
 
316 aa  195  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0154  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  39.58 
 
 
289 aa  195  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.383196  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0179  prenyltransferase  39.15 
 
 
294 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3757  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  40.35 
 
 
298 aa  192  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.987764  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3210  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  37.72 
 
 
290 aa  189  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0129824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4282  prenyltransferase  42.71 
 
 
290 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0218  prenyltransferase  39.26 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0316  prenyltransferase  42.14 
 
 
294 aa  183  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.65204e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0324  prenyltransferase  39.78 
 
 
290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1038  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.87 
 
 
283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0379188  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1902  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.86 
 
 
288 aa  182  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2322  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  46.95 
 
 
319 aa  179  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0288  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  42.91 
 
 
294 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_002620  TC0492  prenyltransferase  32.3 
 
 
302 aa  134  3e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.203515  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0369  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  40.17 
 
 
286 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.1864  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4209  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  42.58 
 
 
301 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102097  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0398  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  40.28 
 
 
286 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.967191  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1101  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30 
 
 
302 aa  123  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0397  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  40.74 
 
 
286 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0609  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  37.98 
 
 
289 aa  122  9e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000295673 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2096  prenyltransferase  33.67 
 
 
301 aa  120  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1574  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  37.82 
 
 
284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000853939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4497  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.93 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0633254  normal  0.801833 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.95 
 
 
286 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0469  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.21 
 
 
288 aa  106  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1512  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  37.93 
 
 
293 aa  106  4e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.378404  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0477  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.93 
 
 
321 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.036458  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1703  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  38.81 
 
 
291 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00297592 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3384  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.34 
 
 
286 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0393  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  33.74 
 
 
334 aa  100  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.275276  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.05 
 
 
286 aa  97.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0581  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.38 
 
 
292 aa  95.5  9e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00583623  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0415  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  36.31 
 
 
333 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.638328  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0530  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  35.67 
 
 
342 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0423  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  35.67 
 
 
333 aa  94  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0441  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.41 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.351552  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5382  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  31.2 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0824  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  31.78 
 
 
316 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129328  normal  0.188314 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25.9 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0588  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  31.03 
 
 
322 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.262938 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2246  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  28.94 
 
 
326 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0326669  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0442  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.04 
 
 
286 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0582  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.74 
 
 
295 aa  86.7  4e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00112694  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0543  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  34.9 
 
 
319 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00391921  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  34.93 
 
 
327 aa  86.3  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884391  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0857  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  31.06 
 
 
316 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  0.0717039 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0897  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  31.06 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.841681 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3817  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25.69 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0824  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.76 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0965  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.92 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291497  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3891  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25.69 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4014  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25.69 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1217  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.32 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.45215  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0572  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.56 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0054  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  32.32 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0138918  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1486  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.16 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1613  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.28 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0142555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2247  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  32.48 
 
 
322 aa  82.4  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0799329  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0596  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  32.82 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3680  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  35.98 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.791874  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2904  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  34.9 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.520314 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3808  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  31.94 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.466325  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0470  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25.69 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.517028  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>