More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0216 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0216  prenyltransferase  100 
 
 
289 aa  570  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0232  prenyltransferase  97.23 
 
 
289 aa  554  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3393  prenyltransferase  73.61 
 
 
298 aa  431  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.604924  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0439  prenyltransferase  74.48 
 
 
298 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4282  prenyltransferase  72.7 
 
 
290 aa  388  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0290  prenyltransferase  70.82 
 
 
294 aa  388  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0397  prenyltransferase  67.51 
 
 
288 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0578839  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1642  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  52.71 
 
 
288 aa  275  6e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000163597  hitchhiker  0.000177329 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0096  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.61 
 
 
285 aa  273  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3612  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  51.88 
 
 
287 aa  258  7e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0316  prenyltransferase  55.4 
 
 
294 aa  257  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.65204e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2196  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  48.2 
 
 
284 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1451  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  44.41 
 
 
294 aa  242  6e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0139046  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0678  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  48.01 
 
 
282 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0184181  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1088  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  45.13 
 
 
284 aa  232  5e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0563652  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2388  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  46.47 
 
 
283 aa  229  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306171  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3210  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  46.15 
 
 
290 aa  226  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0129824  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1490  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  41.4 
 
 
285 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512063  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3374  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  44.15 
 
 
287 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0975  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.91 
 
 
288 aa  221  8e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14810  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.14 
 
 
287 aa  215  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2015  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  44.04 
 
 
287 aa  215  8e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0176  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  45.85 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0715636  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1811  prenyltransferase  41.58 
 
 
286 aa  209  4e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1337  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  43.42 
 
 
286 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  47.57 
 
 
288 aa  209  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0516  prenyltransferase  40.07 
 
 
319 aa  206  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.494925 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0256  prenyltransferase  41.75 
 
 
314 aa  202  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.991703  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1429  prenyltransferase  38.46 
 
 
291 aa  202  5e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8072  prenyltransferase  40.56 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3757  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  43.36 
 
 
298 aa  199  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.987764  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1392  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  41.64 
 
 
285 aa  199  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6114  prenyltransferase  40 
 
 
315 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1038  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  40.53 
 
 
283 aa  197  3e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0379188  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0823  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  37.25 
 
 
311 aa  195  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.167929  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0288  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  45.74 
 
 
294 aa  192  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1902  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  43.87 
 
 
288 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0200  prenyltransferase  38.57 
 
 
294 aa  188  9e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0160  prenyltransferase  38.57 
 
 
294 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.579339  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0651  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  40.81 
 
 
303 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00254514  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0324  prenyltransferase  41.52 
 
 
290 aa  185  9e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0154  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  37.77 
 
 
289 aa  185  9e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.383196  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4513  prenyltransferase  39.57 
 
 
316 aa  183  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0179  prenyltransferase  37.77 
 
 
294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2205  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.91 
 
 
294 aa  181  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0818  prenyltransferase  38.69 
 
 
289 aa  179  4e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00247672  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4093  prenyltransferase  39.49 
 
 
316 aa  179  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0218  prenyltransferase  37.86 
 
 
289 aa  178  8e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1159  prenyltransferase  38.69 
 
 
286 aa  175  9e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.848518  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2322  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  43.66 
 
 
319 aa  166  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4209  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  41.75 
 
 
301 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102097  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0369  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  38.89 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.1864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0397  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.89 
 
 
286 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0398  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  38.89 
 
 
286 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.967191  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0492  prenyltransferase  33.33 
 
 
302 aa  108  1e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.203515  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0609  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  33.33 
 
 
289 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000295673 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1512  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  35.98 
 
 
293 aa  107  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.378404  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1574  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  36.68 
 
 
284 aa  103  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000853939 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2096  prenyltransferase  28.27 
 
 
301 aa  100  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1101  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  31.07 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0543  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  31.86 
 
 
319 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00391921  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0581  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.57 
 
 
292 aa  90.5  3e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00583623  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0477  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.12 
 
 
321 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.036458  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0588  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.57 
 
 
322 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.262938 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1964  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.96 
 
 
310 aa  89.4  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.855973  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0824  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.32 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129328  normal  0.188314 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1703  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  35.04 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00297592 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0469  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.24 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4142  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.89 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.356002  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0582  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.59 
 
 
295 aa  84  0.000000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00112694  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0415  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.88 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.638328  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3837  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.95 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0373903  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0423  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.88 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0572  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0857  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.13 
 
 
316 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  0.0717039 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0441  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  25.2 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.351552  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.57 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1486  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  28.52 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0897  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.13 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.841681 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2611  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.72 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0530  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  31.51 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0363  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  32.14 
 
 
324 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5382  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  29.31 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4497  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  24.92 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0633254  normal  0.801833 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0965  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.68 
 
 
317 aa  79  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291497  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3531  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.75 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3913  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.44 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2895  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.43 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0359  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.38 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2904  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  31.61 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.520314 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3384  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.69 
 
 
286 aa  77  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3733  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.39 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000311091  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2562  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.29 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0653  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.77 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.110294  normal  0.440734 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3679  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.19 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2421  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.24 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.755837  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1685  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.38 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3527  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.16 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.48 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884391  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3080  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.39 
 
 
320 aa  75.5  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>