More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2362 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2362  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  100 
 
 
328 aa  624  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.620404  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2271  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  65.53 
 
 
302 aa  325  4.0000000000000003e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.872623  normal  0.993319 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0951  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  61.59 
 
 
304 aa  318  9e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2242  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  49.51 
 
 
308 aa  250  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161833  normal  0.0898347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0653  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  49.01 
 
 
340 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.110294  normal  0.440734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4114  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  48.63 
 
 
316 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0588  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  49.32 
 
 
322 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.262938 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0359  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  50.49 
 
 
312 aa  238  8e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0543  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  48.98 
 
 
319 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00391921  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2562  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  48.16 
 
 
307 aa  235  8e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1344  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  47.42 
 
 
316 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.256325  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1685  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  51.69 
 
 
310 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1849  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  46.69 
 
 
316 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000654272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4711  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50.56 
 
 
310 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3184  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50 
 
 
313 aa  229  6e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934853  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0530  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  49.16 
 
 
342 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1486  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  46.84 
 
 
323 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0572  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  48.84 
 
 
307 aa  223  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5382  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  51.23 
 
 
315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2246  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  51.59 
 
 
326 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0326669  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2904  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  50.17 
 
 
329 aa  216  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.520314 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0477  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  46.18 
 
 
321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.036458  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3112  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  46.28 
 
 
305 aa  215  8e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0897  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  49.47 
 
 
316 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.841681 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0363  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  50.53 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2247  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  48.95 
 
 
322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0799329  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  47.42 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884391  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0423  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  48.16 
 
 
333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0393  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  39.68 
 
 
334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.275276  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0415  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  47.83 
 
 
333 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.638328  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0857  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  49.47 
 
 
316 aa  209  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  0.0717039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0824  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  50.18 
 
 
316 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129328  normal  0.188314 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43450  predicted protein  45.21 
 
 
404 aa  208  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0229957  normal  0.0842835 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1008  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  43.34 
 
 
333 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1877  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  53.55 
 
 
286 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218017  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2668  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  43.34 
 
 
333 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.305023  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3913  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  43.1 
 
 
318 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3100  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  44.56 
 
 
322 aa  203  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0625  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  45.75 
 
 
323 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0965  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  45.17 
 
 
317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291497  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3080  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  40.39 
 
 
320 aa  192  9e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0217  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.45 
 
 
330 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12269  predicted protein  41.14 
 
 
300 aa  186  7e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2235  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  40.29 
 
 
304 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396167  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0140  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  36.01 
 
 
287 aa  176  6e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.654949  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2048  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  36.01 
 
 
287 aa  175  8e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01780  prenyltransferase, putative  40.44 
 
 
373 aa  174  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.451641  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1316  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  36.19 
 
 
285 aa  167  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5476  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  37.05 
 
 
296 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5031  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.41 
 
 
296 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002146  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  35.38 
 
 
284 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0156  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.93 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.33 
 
 
286 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2161  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  35.97 
 
 
285 aa  162  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_87025  Para-hydroxybenzoate--polyprenyltransferase, mitochondrial precursor (PHB:polyprenyltransferase)  35.76 
 
 
285 aa  160  2e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4399  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  41.67 
 
 
284 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6135  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.79 
 
 
296 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00272  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.61 
 
 
284 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.27 
 
 
286 aa  160  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70730  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.07 
 
 
296 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4497  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.16 
 
 
286 aa  159  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0633254  normal  0.801833 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2895  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.18 
 
 
285 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1018  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  40.34 
 
 
290 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5604  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.05 
 
 
296 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  34.89 
 
 
286 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0442  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.55 
 
 
286 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2283  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  38.1 
 
 
289 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642168 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3891  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.55 
 
 
286 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3817  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.55 
 
 
286 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48510  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  40.22 
 
 
295 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.826372  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4014  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.55 
 
 
286 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0965  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.41 
 
 
299 aa  155  7e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271339  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3384  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.61 
 
 
286 aa  155  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4409  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  34.68 
 
 
296 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0458215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3372  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.29 
 
 
286 aa  153  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.962775  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0470  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  40.91 
 
 
286 aa  153  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.517028  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0581  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  34.8 
 
 
292 aa  153  5e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00583623  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0474  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  40.91 
 
 
286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3557  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  40.91 
 
 
286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.393254  normal  0.712542 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0420  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.78 
 
 
290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2438  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  41.01 
 
 
293 aa  152  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0441  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  35.59 
 
 
291 aa  149  4e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.351552  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0128  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  42.11 
 
 
289 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0469  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  34.39 
 
 
288 aa  149  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2657  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.46 
 
 
287 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0502298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5365  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.57 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.346697 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3815  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.12 
 
 
287 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1613  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  37.69 
 
 
288 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0142555 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3837  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.57 
 
 
299 aa  146  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0373903  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0044  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.27 
 
 
299 aa  146  5e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5318  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.86 
 
 
296 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5226  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.86 
 
 
296 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.46324 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1217  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.9 
 
 
285 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.45215  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3595  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  42.38 
 
 
294 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0645  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.12 
 
 
290 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0326  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  35.77 
 
 
289 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0277634 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0596  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.46 
 
 
295 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0053  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.27 
 
 
299 aa  144  3e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0716312  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0619  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.67 
 
 
290 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3808  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  40.08 
 
 
311 aa  142  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.466325  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>