More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2246 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2246  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  100 
 
 
326 aa  631  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0326669  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0363  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  85.58 
 
 
324 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5382  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  73.29 
 
 
315 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0824  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  72.01 
 
 
316 aa  384  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129328  normal  0.188314 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0857  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  71.52 
 
 
316 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  0.0717039 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0897  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  70.44 
 
 
316 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.841681 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4114  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  59.55 
 
 
316 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1486  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  58.33 
 
 
323 aa  335  7.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1685  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  62.67 
 
 
310 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2562  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  58.44 
 
 
307 aa  330  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1849  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  58.22 
 
 
316 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000654272 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1344  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  57.05 
 
 
316 aa  328  8e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.256325  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3184  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  60.54 
 
 
313 aa  325  8.000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934853  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4711  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  60.84 
 
 
310 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2904  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  58.97 
 
 
329 aa  308  9e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.520314 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0530  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  52.92 
 
 
342 aa  295  7e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0653  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  55.23 
 
 
340 aa  293  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.110294  normal  0.440734 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2247  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  54.94 
 
 
322 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0799329  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0588  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50.64 
 
 
322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.262938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0543  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50.32 
 
 
319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00391921  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0423  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  52.27 
 
 
333 aa  281  9e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0415  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  52.27 
 
 
333 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.638328  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0477  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  51.95 
 
 
321 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.036458  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0393  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  45.51 
 
 
334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.275276  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0625  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50.96 
 
 
323 aa  273  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2668  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  48.91 
 
 
333 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.305023  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1008  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  48.91 
 
 
333 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3913  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  48.53 
 
 
318 aa  266  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2242  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50 
 
 
308 aa  263  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161833  normal  0.0898347 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0572  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.99 
 
 
307 aa  263  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3100  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50.17 
 
 
322 aa  258  7e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  54.81 
 
 
327 aa  258  9e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884391  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3080  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  44.97 
 
 
320 aa  255  9e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0217  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  45.99 
 
 
330 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0965  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  46.45 
 
 
317 aa  246  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0359  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  48.3 
 
 
312 aa  229  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2271  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  52.31 
 
 
302 aa  220  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.872623  normal  0.993319 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43450  predicted protein  45.49 
 
 
404 aa  220  3e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0229957  normal  0.0842835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2235  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.05 
 
 
304 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396167  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2362  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  51.59 
 
 
328 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.620404  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12269  predicted protein  43.15 
 
 
300 aa  204  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0951  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50.89 
 
 
304 aa  202  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01780  prenyltransferase, putative  42.41 
 
 
373 aa  201  9.999999999999999e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.451641  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3112  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  45.17 
 
 
305 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4497  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.5 
 
 
286 aa  186  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0633254  normal  0.801833 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.62 
 
 
286 aa  182  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.86 
 
 
286 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3384  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.14 
 
 
286 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48510  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.07 
 
 
295 aa  179  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.826372  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1877  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  49.82 
 
 
286 aa  178  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0469  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.4 
 
 
288 aa  178  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3891  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.21 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3817  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.21 
 
 
286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0442  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.21 
 
 
286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4014  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.21 
 
 
286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5031  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.69 
 
 
296 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3595  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  36.93 
 
 
294 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5476  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  35.61 
 
 
296 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.01 
 
 
286 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5604  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.2 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4409  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.41 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0458215 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6135  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.92 
 
 
296 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3837  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.31 
 
 
299 aa  162  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0373903  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0420  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.05 
 
 
290 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4399  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  36.88 
 
 
284 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3401  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.96 
 
 
287 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0474  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.72 
 
 
286 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3557  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.72 
 
 
286 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.393254  normal  0.712542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70730  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.84 
 
 
296 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3372  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.14 
 
 
286 aa  159  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.962775  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0470  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.37 
 
 
286 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.517028  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_87025  Para-hydroxybenzoate--polyprenyltransferase, mitochondrial precursor (PHB:polyprenyltransferase)  36.3 
 
 
285 aa  159  7e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00272  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  33.22 
 
 
284 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0140  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  34.41 
 
 
287 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.654949  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2048  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  34.41 
 
 
287 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0156  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.79 
 
 
296 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0483  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.11 
 
 
302 aa  155  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1316  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  35.47 
 
 
285 aa  155  1e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002146  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.86 
 
 
284 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2611  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.72 
 
 
290 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0128  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  36.62 
 
 
289 aa  153  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3469  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  36.04 
 
 
287 aa  153  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.689102  normal  0.729322 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3527  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.59 
 
 
294 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0596  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.79 
 
 
295 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5365  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.79 
 
 
296 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.346697 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03912  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.69 
 
 
290 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3953  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  36.69 
 
 
290 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4280  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.38 
 
 
290 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4502  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.69 
 
 
290 aa  151  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3988  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.69 
 
 
290 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5521  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.69 
 
 
290 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.272125  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4593  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.69 
 
 
290 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.568331  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03872  hypothetical protein  36.69 
 
 
290 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4557  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.69 
 
 
290 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3252  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.89 
 
 
298 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5064  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  39.57 
 
 
286 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0965  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.3 
 
 
299 aa  150  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271339  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5318  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.07 
 
 
296 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2161  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  36.24 
 
 
285 aa  149  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5226  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.07 
 
 
296 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.46324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>