More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5382 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5382  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  100 
 
 
315 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.309179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0824  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  76.87 
 
 
316 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129328  normal  0.188314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0897  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  74.27 
 
 
316 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.841681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2246  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  73.29 
 
 
326 aa  391  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0326669  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0857  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  74.59 
 
 
316 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  0.0717039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0363  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  75.24 
 
 
324 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4114  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  59.34 
 
 
316 aa  348  9e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1486  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  61.26 
 
 
323 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1344  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  57 
 
 
316 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.256325  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1849  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  56.07 
 
 
316 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000654272 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2562  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  57.95 
 
 
307 aa  323  3e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4711  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  59.41 
 
 
310 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3184  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  59.23 
 
 
313 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1685  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  59.67 
 
 
310 aa  315  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0530  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  51.94 
 
 
342 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2904  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  57.79 
 
 
329 aa  286  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.520314 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0477  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50.79 
 
 
321 aa  285  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.036458  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0415  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  52.75 
 
 
333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.638328  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0423  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  52.43 
 
 
333 aa  280  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2247  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  56.17 
 
 
322 aa  278  9e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0799329  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0543  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50.96 
 
 
319 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00391921  normal  0.561586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0588  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  51.6 
 
 
322 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.262938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0653  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  53.95 
 
 
340 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.110294  normal  0.440734 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0625  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  53.4 
 
 
323 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3913  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50.33 
 
 
318 aa  265  8e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0393  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  44.16 
 
 
334 aa  265  8e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.275276  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2668  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  49.34 
 
 
333 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.305023  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1008  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  49.34 
 
 
333 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3080  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  47.73 
 
 
320 aa  259  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0718  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  55.15 
 
 
327 aa  255  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.884391  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3100  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  49.33 
 
 
322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0965  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  48.85 
 
 
317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.291497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2242  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  48.68 
 
 
308 aa  251  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.161833  normal  0.0898347 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0217  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  48.51 
 
 
330 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0572  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.17 
 
 
307 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.168816  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0359  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  48.99 
 
 
312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43450  predicted protein  46.51 
 
 
404 aa  225  7e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0229957  normal  0.0842835 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12269  predicted protein  46.1 
 
 
300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0951  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50.71 
 
 
304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2235  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  42.41 
 
 
304 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396167  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2271  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50 
 
 
302 aa  212  5.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.872623  normal  0.993319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2362  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  51.23 
 
 
328 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.620404  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01780  prenyltransferase, putative  42.4 
 
 
373 aa  196  5.000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.451641  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3384  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  41.49 
 
 
286 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0442  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  41.67 
 
 
286 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3112  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  44.93 
 
 
305 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  41.13 
 
 
286 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5031  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.57 
 
 
296 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0469  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  40.43 
 
 
288 aa  186  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3817  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  41.32 
 
 
286 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4014  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  41.32 
 
 
286 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3891  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  41.32 
 
 
286 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.79 
 
 
286 aa  185  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4497  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  40.43 
 
 
286 aa  183  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0633254  normal  0.801833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  40.28 
 
 
286 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6135  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.49 
 
 
296 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70730  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.14 
 
 
296 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48510  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.97 
 
 
295 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.826372  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5476  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  36.86 
 
 
296 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3837  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.67 
 
 
299 aa  175  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0373903  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3527  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.29 
 
 
294 aa  175  9e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4409  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.54 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0458215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0470  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  40.28 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.517028  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0474  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.72 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3557  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.72 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.393254  normal  0.712542 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3595  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  39.07 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0511  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.92 
 
 
287 aa  172  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0140  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  37.41 
 
 
287 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.654949  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2048  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  37.41 
 
 
287 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1877  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  45.94 
 
 
286 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218017  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0420  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.02 
 
 
290 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0156  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.52 
 
 
296 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3372  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.89 
 
 
286 aa  169  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.962775  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5604  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.49 
 
 
296 aa  169  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00272  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.61 
 
 
284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5318  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.86 
 
 
296 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3401  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.82 
 
 
287 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5226  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.86 
 
 
296 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.46324 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0730  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.25 
 
 
287 aa  165  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2895  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.56 
 
 
285 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3252  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  38.18 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5365  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.52 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.346697 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0965  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.76 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271339  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3773  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.92 
 
 
288 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0679  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.56 
 
 
288 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0053  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  35.07 
 
 
299 aa  162  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0716312  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3863  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  36.56 
 
 
288 aa  162  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.508575  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_87025  Para-hydroxybenzoate--polyprenyltransferase, mitochondrial precursor (PHB:polyprenyltransferase)  38.93 
 
 
285 aa  161  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2330  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  37.54 
 
 
295 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0044  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  34.72 
 
 
299 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0128  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  37.19 
 
 
289 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0483  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.37 
 
 
302 aa  160  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0380  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  40.07 
 
 
290 aa  159  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0371  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  40.07 
 
 
290 aa  159  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.156009  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002146  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  33.94 
 
 
284 aa  159  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2161  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  36.17 
 
 
285 aa  158  9e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0824  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  40.83 
 
 
292 aa  158  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0126  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  34.25 
 
 
287 aa  158  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2283  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  36.82 
 
 
289 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642168 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2611  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  37.59 
 
 
290 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>