More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0413 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0413  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  100 
 
 
296 aa  595  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2519  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  63.93 
 
 
287 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  0.917266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3815  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  63.73 
 
 
287 aa  358  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2657  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  63.03 
 
 
287 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0502298 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0697  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  63.73 
 
 
287 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370156  normal  0.206083 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0054  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  63.16 
 
 
296 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0138918  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0245  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  63.03 
 
 
287 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0729  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  63.03 
 
 
287 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.262552  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2611  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  65.96 
 
 
290 aa  353  2e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0619  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  63.03 
 
 
290 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0645  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  63.03 
 
 
290 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0463  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  67.59 
 
 
293 aa  349  3e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1286  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  62.32 
 
 
310 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0715  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  65 
 
 
287 aa  333  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.959768 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0824  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  66.78 
 
 
292 aa  332  5e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0312  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  61.54 
 
 
370 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1173  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  61.54 
 
 
370 aa  330  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  61.54 
 
 
316 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.38401  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3361  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  61.54 
 
 
316 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230126  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2582  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  61.75 
 
 
287 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3350  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  61.75 
 
 
287 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3316  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  61.75 
 
 
287 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3983  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  64.64 
 
 
287 aa  328  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.642298 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2803  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  63.16 
 
 
285 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2939  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  61.81 
 
 
294 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105208  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2509  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  59.79 
 
 
291 aa  305  6e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2686  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  63.08 
 
 
291 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2921  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  59.86 
 
 
280 aa  299  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472236  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4497  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.15 
 
 
286 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0633254  normal  0.801833 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02871  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  55.56 
 
 
299 aa  296  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.98 
 
 
286 aa  295  6e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5476  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  53.62 
 
 
296 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5031  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.99 
 
 
296 aa  292  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002146  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  53.02 
 
 
284 aa  291  8e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00272  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.67 
 
 
284 aa  291  8e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5064  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  54.74 
 
 
286 aa  290  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3595  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  51.06 
 
 
294 aa  289  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2048  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  50.88 
 
 
287 aa  287  1e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2330  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  52.82 
 
 
295 aa  287  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0140  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  50.87 
 
 
287 aa  287  2e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.654949  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3384  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.1 
 
 
286 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0371  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  52.03 
 
 
290 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.156009  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0380  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.03 
 
 
290 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.35 
 
 
286 aa  285  9e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4409  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  54.74 
 
 
296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0458215 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0468  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  54.23 
 
 
286 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5604  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.59 
 
 
296 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0469  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.17 
 
 
288 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1217  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.1 
 
 
285 aa  279  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.45215  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0965  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.25 
 
 
299 aa  279  4e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271339  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0470  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  54.23 
 
 
286 aa  279  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.517028  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0596  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.28 
 
 
295 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3837  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.19 
 
 
299 aa  278  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0373903  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0474  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.87 
 
 
286 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3557  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.87 
 
 
286 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.393254  normal  0.712542 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3372  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.33 
 
 
286 aa  277  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.962775  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4014  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.93 
 
 
286 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3817  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.93 
 
 
286 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3891  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.93 
 
 
286 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00072  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.53 
 
 
286 aa  276  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0442  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.93 
 
 
286 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1016  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  54.2 
 
 
297 aa  275  7e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3743  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  56.66 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.33566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3680  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  53.05 
 
 
296 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.791874  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0474  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.75 
 
 
286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3808  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  54.29 
 
 
311 aa  272  6e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.466325  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2895  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  54.48 
 
 
285 aa  271  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1786  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  54.96 
 
 
287 aa  271  9e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1503  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  54.61 
 
 
287 aa  270  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.943321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48510  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.19 
 
 
295 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.826372  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1613  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  51.94 
 
 
288 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0142555 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4280  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.04 
 
 
290 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03872  hypothetical protein  51.04 
 
 
290 aa  269  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03912  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.04 
 
 
290 aa  269  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3953  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  51.04 
 
 
290 aa  269  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4593  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.04 
 
 
290 aa  269  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.568331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5521  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.04 
 
 
290 aa  269  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.272125  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4557  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.04 
 
 
290 aa  269  4e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4502  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.04 
 
 
290 aa  269  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3988  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.04 
 
 
290 aa  269  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0053  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  48.93 
 
 
299 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0716312  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4399  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  48.24 
 
 
284 aa  268  8.999999999999999e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0044  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  48.57 
 
 
299 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0156  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.46 
 
 
296 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3252  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.28 
 
 
298 aa  266  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70730  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.9 
 
 
296 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1336  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.92 
 
 
292 aa  265  7e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6135  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.3 
 
 
296 aa  265  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0420  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  51.24 
 
 
290 aa  264  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0067  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  52.24 
 
 
273 aa  264  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.209668  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5365  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.53 
 
 
296 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.346697 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0326  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  52.67 
 
 
289 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0277634 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5318  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  49.82 
 
 
296 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5226  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  49.82 
 
 
296 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.46324 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0592  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  51.57 
 
 
300 aa  260  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0744  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  51.57 
 
 
300 aa  260  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000571942  hitchhiker  0.00000066778 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3401  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50.72 
 
 
287 aa  260  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0128  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  51.21 
 
 
289 aa  258  7e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0511  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  52.38 
 
 
287 aa  258  9e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2421  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  53.71 
 
 
284 aa  258  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.755837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>