36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0118 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0118  prenyltransferase  100 
 
 		 284 aa  547  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2374  prenyltransferase  40.84 
 
 		 293 aa  179  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0270715  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1361  UbiA prenyltransferase  40.29 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.321745 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1898  prenyltransferase  40.37 
 
 		 299 aa  168  9e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.622194 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2703  UbiA prenyltransferase  38.97 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2047  UbiA prenyltransferase  39.85 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1002  UbiA prenyltransferase  37.36 
 
 		 340 aa  152  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04400  prenyltransferase  34.82 
 
 		 294 aa  89.4  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2205  prenyltransferase  36.79 
 
 		 283 aa  86.3  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13800  prenyltransferase  34.15 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0993725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12800  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  33.8 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2888  UbiA prenyltransferase  32.06 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0837805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3488  prenyltransferase  32.7 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0337  prenyltransferase  32.67 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0802172 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0848  prenyltransferase  35.62 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0221544  normal  0.0909902 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21210  prenyltransferase  32.94 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0209  bacteriochlorophyll c synthase  27.93 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  27.7 
 
 		 333 aa  53.5  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2360  bacteriochlorophyll c synthase  27.7 
 
 		 333 aa  52.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.663632  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0941  bacteriochlorophyll c synthase  25.35 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0238  bacteriochlorophyll c synthase  24.14 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.325704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0427  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.02 
 
 		 315 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04901  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.69 
 
 		 315 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04521  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.59 
 
 		 315 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04831  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.59 
 
 		 315 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1811  prenyltransferase  24.7 
 
 		 286 aa  46.2  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0386  tocopherol phytyltransferase  28.37 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000735368  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1998  bacteriochlorophyll c synthase  25.62 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0012  tocopherol phytyltransferase  23.05 
 
 		 318 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6422  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.75 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0806  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.68 
 
 		 317 aa  43.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.196063  hitchhiker  0.00946917 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1538  bacteriochlorophyll c synthase  26.35 
 
 		 338 aa  42.7  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0726  tocopherol phytyltransferase  26.83 
 
 		 314 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00119936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0010  tocopherol phytyltransferase  23.05 
 
 		 318 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3881  tocopherol phytyltransferase  27.39 
 
 		 349 aa  42.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.630797  decreased coverage  0.00732369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.7 
 
 		 315 aa  42.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>