19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2888 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2888  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
289 aa  555  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0837805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3488  prenyltransferase  71.38 
 
 
300 aa  395  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04400  prenyltransferase  59.15 
 
 
294 aa  291  7e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13800  prenyltransferase  54.36 
 
 
294 aa  288  6e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0993725  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12800  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  55.29 
 
 
318 aa  285  7e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181284  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0337  prenyltransferase  51.56 
 
 
286 aa  266  4e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0802172 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21210  prenyltransferase  57.05 
 
 
294 aa  239  5e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2205  prenyltransferase  34.35 
 
 
283 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2047  UbiA prenyltransferase  34.48 
 
 
287 aa  109  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2374  prenyltransferase  35.92 
 
 
293 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0270715  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2703  UbiA prenyltransferase  35.02 
 
 
290 aa  92.8  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1898  prenyltransferase  34.65 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.622194 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1361  UbiA prenyltransferase  34.27 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.321745 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1002  UbiA prenyltransferase  31.88 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0848  prenyltransferase  35.74 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0221544  normal  0.0909902 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0118  prenyltransferase  33.01 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0209  bacteriochlorophyll c synthase  26.57 
 
 
334 aa  43.5  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3217  UbiA prenyltransferase  27.93 
 
 
315 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000417906  normal  0.0803548 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1995  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.37 
 
 
301 aa  42.7  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>