43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1002 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1002  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 340 aa  666    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2703  UbiA prenyltransferase  76.53 
 
 		 290 aa  402  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1898  prenyltransferase  65.09 
 
 		 299 aa  318  7.999999999999999e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.622194 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1361  UbiA prenyltransferase  58.48 
 
 		 296 aa  318  1e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.321745 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2374  prenyltransferase  59.52 
 
 		 293 aa  317  2e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0270715  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2047  UbiA prenyltransferase  38.85 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0118  prenyltransferase  37.31 
 
 		 284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2205  prenyltransferase  34.93 
 
 		 283 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3488  prenyltransferase  34.36 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0337  prenyltransferase  32.9 
 
 		 286 aa  95.9  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0802172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12800  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  32.87 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13800  prenyltransferase  33.33 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0993725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04400  prenyltransferase  34.95 
 
 		 294 aa  89.7  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21210  prenyltransferase  38.14 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2888  UbiA prenyltransferase  33.81 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0837805 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0848  prenyltransferase  34.7 
 
 		 292 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0221544  normal  0.0909902 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3472  tocopherol phytyltransferase  28.3 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00788485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  32.48 
 
 		 315 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0012  tocopherol phytyltransferase  26.67 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0010  tocopherol phytyltransferase  26.67 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0002  tocopherol phytyltransferase  25.81 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5287  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.52 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2738  predicted protein  27.78 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1811  prenyltransferase  28.63 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.06 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3747  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.13 
 
 		 297 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2096  prenyltransferase  26.63 
 
 		 301 aa  46.6  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3462  UbiA prenyltransferase  25 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0415  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.12 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.638328  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1600  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.63 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1101  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.22 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0530  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  31.48 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0423  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  31.52 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0726  tocopherol phytyltransferase  25.81 
 
 		 314 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00119936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0627  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.13 
 
 		 303 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1210  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  27.65 
 
 		 305 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.441233  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.11 
 
 		 318 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0387  UbiA prenyltransferase  26.82 
 
 		 257 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00875631  normal  0.894158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.33 
 
 		 274 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3881  tocopherol phytyltransferase  23.89 
 
 		 349 aa  43.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.630797  decreased coverage  0.00732369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5665  UbiA prenyltransferase  30.5 
 
 		 334 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.91 
 
 		 299 aa  42.7  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2227  bacteriochlorophyll c synthase  25.37 
 
 		 335 aa  42.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>