102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0010 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0010  tocopherol phytyltransferase  100 
 
 
318 aa  624  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0012  tocopherol phytyltransferase  99.69 
 
 
318 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0002  tocopherol phytyltransferase  61.54 
 
 
299 aa  362  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3881  tocopherol phytyltransferase  57.49 
 
 
349 aa  352  4e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.630797  decreased coverage  0.00732369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3472  tocopherol phytyltransferase  56.87 
 
 
318 aa  347  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00788485  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3462  UbiA prenyltransferase  55.67 
 
 
313 aa  328  1.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0726  tocopherol phytyltransferase  54.75 
 
 
314 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00119936  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47601  predicted protein  38.11 
 
 
404 aa  189  8e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0386  tocopherol phytyltransferase  39.58 
 
 
300 aa  186  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000735368  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32069  predicted protein  36.39 
 
 
319 aa  159  4e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2738  predicted protein  37.23 
 
 
235 aa  145  8.000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119481  homogentisate phytylprenyltransferase/homogentisic acid geranylgeranyl transferase  33.33 
 
 
387 aa  126  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18364  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0279  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.25 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0728517  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3992  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.9 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1922  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.25 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.21 
 
 
315 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1719  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.3 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.641378  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1016  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.48 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0368  bacteriochlorophyll c synthase  28.89 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.259035  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1538  bacteriochlorophyll c synthase  25.93 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1302  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.7 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5287  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  21.34 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111529  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3747  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.47 
 
 
297 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  27.23 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0209  bacteriochlorophyll c synthase  27.37 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  21.76 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0238  bacteriochlorophyll c synthase  25.56 
 
 
334 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.325704  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.15 
 
 
274 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2227  bacteriochlorophyll c synthase  25.84 
 
 
335 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3530  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.8 
 
 
301 aa  63.2  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.47035 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1998  bacteriochlorophyll c synthase  26.26 
 
 
333 aa  62.4  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.52 
 
 
299 aa  62  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2703  UbiA prenyltransferase  26.32 
 
 
290 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1733  UbiA prenyltransferase  30.12 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1600  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.8 
 
 
305 aa  60.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2226  bacteriochlorophyll c synthase  25.28 
 
 
336 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  27.8 
 
 
282 aa  60.1  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  24.18 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2360  bacteriochlorophyll c synthase  24.18 
 
 
333 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.663632  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2374  prenyltransferase  27.49 
 
 
293 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0270715  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1361  UbiA prenyltransferase  22.75 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.321745 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0627  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  22.86 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1449  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.56 
 
 
333 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.482254  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6422  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.56 
 
 
300 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  26.29 
 
 
277 aa  57  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  24.77 
 
 
282 aa  57  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.61 
 
 
303 aa  56.6  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1390  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.89 
 
 
334 aa  56.6  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.937819  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  29.07 
 
 
279 aa  56.2  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1210  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  24.87 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.441233  normal  0.145879 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  26.11 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.27 
 
 
300 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1089  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.52 
 
 
333 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2061  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.58 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3752  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.7 
 
 
304 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  hitchhiker  0.000466186 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.56 
 
 
376 aa  53.1  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1002  UbiA prenyltransferase  25.84 
 
 
340 aa  52.8  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  27.64 
 
 
281 aa  52  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1145  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.74 
 
 
333 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2047  UbiA prenyltransferase  26.9 
 
 
287 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3311  prenyltransferase  28.95 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1852  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.01 
 
 
294 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409299 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1898  prenyltransferase  23.64 
 
 
299 aa  50.4  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.622194 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0806  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.41 
 
 
317 aa  50.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.196063  hitchhiker  0.00946917 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  28.28 
 
 
281 aa  50.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2096  prenyltransferase  23.5 
 
 
301 aa  49.7  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1642  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  28.99 
 
 
301 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0941  bacteriochlorophyll c synthase  22.91 
 
 
337 aa  49.3  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0427  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.17 
 
 
315 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2065  UbiA prenyltransferase  29.79 
 
 
245 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  25.87 
 
 
267 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1759  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.17 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04831  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.63 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04811  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.17 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.233119  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0555  UbiA prenyltransferase  24.15 
 
 
290 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04521  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.63 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.48 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0566  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  24.68 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12008  Maf-like protein  27.51 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3266  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.93 
 
 
304 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0475034 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  24.19 
 
 
288 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  23.58 
 
 
284 aa  47  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16384  predicted protein  26.38 
 
 
317 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.960686  normal  0.418422 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2632  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.21 
 
 
310 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2084  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.71 
 
 
339 aa  46.2  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.748804 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0020  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  26.8 
 
 
343 aa  46.2  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04901  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.54 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0740  UbiA prenyltransferase  24.4 
 
 
275 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04241  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.07 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1866  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.05 
 
 
326 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1892  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.05 
 
 
326 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0278945  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0876  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.88 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3341  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.13 
 
 
337 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.03622 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0602  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.75 
 
 
330 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.171113  normal  0.0295962 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  26.98 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0583  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  22.63 
 
 
320 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4699  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  25.39 
 
 
317 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000137463  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0708  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.28 
 
 
332 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.630035  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  29.94 
 
 
283 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0749  UbiA prenyltransferase  26.22 
 
 
276 aa  43.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.870578  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>