139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1416 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1416  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
320 aa  644    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000808669  hitchhiker  0.00108845 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1406  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  92.16 
 
 
318 aa  552  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.151808  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2690  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  46.91 
 
 
301 aa  256  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0169  UbiA prenyltransferase  44.7 
 
 
319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3527  UbiA prenyltransferase  42.57 
 
 
304 aa  249  5e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3242  UbiA prenyltransferase  40.61 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000441588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5061  UbiA prenyltransferase  44.16 
 
 
295 aa  240  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5056  UbiA prenyltransferase  44.16 
 
 
295 aa  240  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.397977  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2248  UbiA prenyltransferase  39.68 
 
 
327 aa  236  6e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000928316  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4060  UbiA prenyltransferase  40.74 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000422239  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1995  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  43.01 
 
 
301 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3217  UbiA prenyltransferase  39.04 
 
 
315 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000417906  normal  0.0803548 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1966  UbiA prenyltransferase  40.43 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1818  UbiA prenyltransferase  39.7 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1948  UbiA prenyltransferase  37.59 
 
 
290 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2194  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  38.28 
 
 
331 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  0.405209 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0233  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  38.57 
 
 
291 aa  185  9e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3231  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.89 
 
 
326 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4052  UbiA prenyltransferase  34.47 
 
 
296 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3731  UbiA prenyltransferase  32.23 
 
 
318 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000383911  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0329  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.53 
 
 
294 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2584  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.81 
 
 
280 aa  170  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1645  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1013  UbiA prenyltransferase  32.41 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.810785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4052  UbiA prenyltransferase  35.52 
 
 
295 aa  162  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0321079  normal  0.0610101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6246  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.21 
 
 
321 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.434954  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1642  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.49 
 
 
280 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5665  UbiA prenyltransferase  29.89 
 
 
334 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2111  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.46 
 
 
285 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1405  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 
286 aa  155  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.289114 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1465  UbiA prenyltransferase  34.88 
 
 
288 aa  151  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0342243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1502  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  36.22 
 
 
284 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130276  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1962  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 
284 aa  149  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01330  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  31.77 
 
 
308 aa  145  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.139856  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4030  UbiA prenyltransferase  33.33 
 
 
288 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2376  UbiA prenyltransferase  32.63 
 
 
293 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00872573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0164  UbiA prenyltransferase  32.52 
 
 
306 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1773  UbiA prenyltransferase  31.87 
 
 
312 aa  142  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143657  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0207  UbiA prenyltransferase  30.71 
 
 
308 aa  142  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1739  UbiA prenyltransferase  32.52 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.463163  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03325  hypothetical protein  34.35 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5017  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.79 
 
 
310 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5105  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.79 
 
 
310 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5398  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.79 
 
 
310 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2564  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.09 
 
 
296 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1216  UbiA prenyltransferase  32.56 
 
 
268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3500  UbiA prenyltransferase  33.09 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0251416  normal  0.998384 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13840  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  28.72 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.409705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3882  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0147542 
 
 
-
 
NC_002950  PG0509  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 
286 aa  130  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1162  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 
309 aa  126  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5647  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.31 
 
 
309 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972771  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4253  hypothetical protein  28.03 
 
 
477 aa  116  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.326142 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0811  UbiA prenyltransferase  28.84 
 
 
308 aa  116  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1710  hypothetical protein  32.34 
 
 
503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.792915  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2460  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  29.32 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.372558  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7178  hypothetical protein  29.7 
 
 
475 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1137  hypothetical protein  32.42 
 
 
483 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136806  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1026  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0269  UbiA prenyltransferase  28.42 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0993  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 
281 aa  110  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3635  hypothetical protein  36.65 
 
 
479 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0500  hypothetical protein  32.2 
 
 
472 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19137 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0064  hypothetical protein  33.52 
 
 
489 aa  102  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5594  hypothetical protein  32.22 
 
 
494 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1029  hypothetical protein  28.98 
 
 
485 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0855  hypothetical protein  27.78 
 
 
479 aa  99  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719485  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0803  hypothetical protein  27.72 
 
 
479 aa  99  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2829  hypothetical protein  24.23 
 
 
460 aa  97.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0400356  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0898  hypothetical protein  26.32 
 
 
474 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.897817  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4796  hypothetical protein  27.56 
 
 
631 aa  97.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2161  hypothetical protein  28.78 
 
 
484 aa  95.5  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5788  hypothetical protein  29.86 
 
 
484 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2275  hypothetical protein  31.6 
 
 
473 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.493912 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3784  hypothetical protein  28.42 
 
 
474 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4211  hypothetical protein  28.72 
 
 
482 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3980  hypothetical protein  28.65 
 
 
498 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0272963  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3487  hypothetical protein  27.19 
 
 
508 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0757  hypothetical protein  22.78 
 
 
481 aa  87.4  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0134  UbiA prenyltransferase  35.33 
 
 
180 aa  87  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00304633  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3163  hypothetical protein  28.27 
 
 
508 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147535  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2964  hypothetical protein  26.79 
 
 
479 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0936  hypothetical protein  30.6 
 
 
498 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507653  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2303  hypothetical protein  26.22 
 
 
483 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223349  normal  0.0447884 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0173  hypothetical protein  28.57 
 
 
474 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3359  hypothetical protein  29.21 
 
 
521 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0132  putative transmembrane potein  37.5 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0144788  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1976  UbiA prenyltransferase  29.21 
 
 
344 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000257247 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1811  prenyltransferase  30.06 
 
 
286 aa  59.7  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  28.95 
 
 
302 aa  59.7  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0179  prenyltransferase  32.98 
 
 
294 aa  53.1  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0154  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.78 
 
 
289 aa  52.4  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.383196  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1429  prenyltransferase  28.08 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0160  prenyltransferase  31.91 
 
 
294 aa  50.1  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.579339  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0218  prenyltransferase  32.26 
 
 
289 aa  49.7  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2096  prenyltransferase  36.36 
 
 
301 aa  49.7  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0818  prenyltransferase  33.07 
 
 
289 aa  49.7  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00247672  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  31.97 
 
 
280 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0771  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  37.74 
 
 
259 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0487917  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  27.84 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>