67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0134 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0134  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 180 aa  356  8e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00304633  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1216  UbiA prenyltransferase  50 
 
 		 268 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4052  UbiA prenyltransferase  40.11 
 
 		 295 aa  155  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0321079  normal  0.0610101 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03325  hypothetical protein  33.53 
 
 		 288 aa  126  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1948  UbiA prenyltransferase  37.43 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3731  UbiA prenyltransferase  35.56 
 
 		 318 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000383911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3242  UbiA prenyltransferase  34.05 
 
 		 310 aa  105  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000441588  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4052  UbiA prenyltransferase  32.2 
 
 		 296 aa  101  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4030  UbiA prenyltransferase  33.72 
 
 		 288 aa  99.8  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2690  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.56 
 
 		 301 aa  99  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1966  UbiA prenyltransferase  34.09 
 
 		 301 aa  98.6  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1013  UbiA prenyltransferase  35.84 
 
 		 291 aa  98.2  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.810785 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0233  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.07 
 
 		 291 aa  96.3  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1502  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.91 
 
 		 284 aa  95.1  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130276  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5061  UbiA prenyltransferase  35.63 
 
 		 295 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5056  UbiA prenyltransferase  35.63 
 
 		 295 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.397977  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0329  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.61 
 
 		 294 aa  90.1  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2248  UbiA prenyltransferase  35.39 
 
 		 327 aa  88.2  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000928316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0509  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.3 
 
 		 286 aa  87.4  9e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1416  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.33 
 
 		 320 aa  87  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000808669  hitchhiker  0.00108845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3500  UbiA prenyltransferase  31.55 
 
 		 303 aa  86.3  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0251416  normal  0.998384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4060  UbiA prenyltransferase  33.72 
 
 		 327 aa  85.9  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000422239  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1995  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 301 aa  85.5  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1645  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 296 aa  85.1  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3217  UbiA prenyltransferase  29.71 
 
 		 315 aa  85.1  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000417906  normal  0.0803548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3231  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0169  UbiA prenyltransferase  35.8 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1773  UbiA prenyltransferase  36.08 
 
 		 312 aa  82  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1406  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.88 
 
 		 318 aa  81.3  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.151808  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2584  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  29.71 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6246  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  28.98 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.434954  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2111  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  29.67 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1818  UbiA prenyltransferase  31.58 
 
 		 335 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3527  UbiA prenyltransferase  29.71 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2194  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  30.22 
 
 		 331 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  0.405209 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2564  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32 
 
 		 296 aa  74.3  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1405  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  27.53 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.289114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5665  UbiA prenyltransferase  26.26 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1739  UbiA prenyltransferase  28.07 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.463163  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0164  UbiA prenyltransferase  26.97 
 
 		 306 aa  68.2  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5105  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  25.29 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5017  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  25.29 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5398  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  25.29 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0207  UbiA prenyltransferase  25.84 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1962  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  28.49 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1465  UbiA prenyltransferase  27.67 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0342243  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01330  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  22.35 
 
 		 308 aa  64.3  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.139856  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0811  UbiA prenyltransferase  26.95 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3882  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  24.43 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0147542 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1642  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  24.58 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5594  hypothetical protein  28.68 
 
 		 494 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13840  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  20.67 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.409705 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0993  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  29.7 
 
 		 281 aa  54.7  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1026  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  29.7 
 
 		 281 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3359  hypothetical protein  34.21 
 
 		 521 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2376  UbiA prenyltransferase  24.12 
 
 		 293 aa  48.5  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00872573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0936  hypothetical protein  33.04 
 
 		 498 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507653  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0500  hypothetical protein  32.5 
 
 		 472 aa  48.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19137 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1137  hypothetical protein  26.52 
 
 		 483 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0269  UbiA prenyltransferase  27.43 
 
 		 322 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2460  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  24.78 
 
 		 294 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.372558  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3635  hypothetical protein  30.71 
 
 		 479 aa  45.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3487  hypothetical protein  37.07 
 
 		 508 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1162  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  21.89 
 
 		 309 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3163  hypothetical protein  37.07 
 
 		 508 aa  44.3  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5647  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  20.69 
 
 		 309 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2829  hypothetical protein  23.33 
 
 		 460 aa  41.2  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0400356  normal  0.158878 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>