92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1013 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1013  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 291 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.810785 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1948  UbiA prenyltransferase  52.45 
 
 		 290 aa  292  5e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3731  UbiA prenyltransferase  43.62 
 
 		 318 aa  246  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000383911  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4030  UbiA prenyltransferase  44.13 
 
 		 288 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0233  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  37.81 
 
 		 291 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3242  UbiA prenyltransferase  41.84 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000441588  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3500  UbiA prenyltransferase  44.56 
 
 		 303 aa  202  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0251416  normal  0.998384 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2248  UbiA prenyltransferase  40.19 
 
 		 327 aa  201  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000928316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0329  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  39.45 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0169  UbiA prenyltransferase  43.12 
 
 		 319 aa  196  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4060  UbiA prenyltransferase  38.91 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000422239  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3217  UbiA prenyltransferase  39.59 
 
 		 315 aa  192  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000417906  normal  0.0803548 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1645  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  38.73 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2194  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  38.13 
 
 		 331 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  0.405209 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1966  UbiA prenyltransferase  45.49 
 
 		 301 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2690  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  38.81 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5061  UbiA prenyltransferase  40.7 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5056  UbiA prenyltransferase  40.7 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.397977  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1406  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.92 
 
 		 318 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.151808  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4052  UbiA prenyltransferase  38.03 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1818  UbiA prenyltransferase  35.92 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6246  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  36.62 
 
 		 321 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.434954  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1416  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 320 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000808669  hitchhiker  0.00108845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4052  UbiA prenyltransferase  34.89 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0321079  normal  0.0610101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3231  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  38.31 
 
 		 326 aa  169  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1465  UbiA prenyltransferase  35.25 
 
 		 288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0342243  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3527  UbiA prenyltransferase  36.93 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1995  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  37.1 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1216  UbiA prenyltransferase  34.43 
 
 		 268 aa  152  7e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2584  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1773  UbiA prenyltransferase  41.48 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1405  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.289114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1962  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2564  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  37.46 
 
 		 296 aa  142  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0164  UbiA prenyltransferase  33.33 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03325  hypothetical protein  34.04 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2161  hypothetical protein  33.98 
 
 		 484 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0509  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.92 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5398  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5017  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5105  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5665  UbiA prenyltransferase  32.14 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0207  UbiA prenyltransferase  35.43 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2111  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.4 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3980  hypothetical protein  36.03 
 
 		 498 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0993  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.61 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4253  hypothetical protein  36.57 
 
 		 477 aa  130  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.326142 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5594  hypothetical protein  34.64 
 
 		 494 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1026  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.25 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01330  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  33.86 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.139856  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1029  hypothetical protein  34.47 
 
 		 485 aa  126  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1642  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.1 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5788  hypothetical protein  32.4 
 
 		 484 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0855  hypothetical protein  34.87 
 
 		 479 aa  122  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719485  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0803  hypothetical protein  34.87 
 
 		 479 aa  122  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1502  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.6 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130276  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1710  hypothetical protein  31.7 
 
 		 503 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.792915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0811  UbiA prenyltransferase  34.8 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1137  hypothetical protein  33.21 
 
 		 483 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13840  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.94 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.409705 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0757  hypothetical protein  37.08 
 
 		 481 aa  116  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3882  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  30.94 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0147542 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7178  hypothetical protein  40 
 
 		 475 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0500  hypothetical protein  36.44 
 
 		 472 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0898  hypothetical protein  35.53 
 
 		 474 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.897817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5647  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.24 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1162  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.8 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2964  hypothetical protein  31.54 
 
 		 479 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3635  hypothetical protein  33.72 
 
 		 479 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2275  hypothetical protein  33.67 
 
 		 473 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493912 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1739  UbiA prenyltransferase  36.11 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.463163  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3784  hypothetical protein  33.7 
 
 		 474 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0134  UbiA prenyltransferase  35.84 
 
 		 180 aa  105  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00304633  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2829  hypothetical protein  31.18 
 
 		 460 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0400356  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3487  hypothetical protein  39.57 
 
 		 508 aa  102  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3163  hypothetical protein  39.04 
 
 		 508 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2460  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.33 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.372558  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2376  UbiA prenyltransferase  33.71 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00872573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0936  hypothetical protein  41.04 
 
 		 498 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507653  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3359  hypothetical protein  38.74 
 
 		 521 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0064  hypothetical protein  30.38 
 
 		 489 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0173  hypothetical protein  33.33 
 
 		 474 aa  89.4  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4211  hypothetical protein  33.71 
 
 		 482 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0269  UbiA prenyltransferase  28.62 
 
 		 322 aa  86.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0132  putative transmembrane potein  51.72 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0144788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4796  hypothetical protein  32.63 
 
 		 631 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2303  hypothetical protein  28.84 
 
 		 483 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223349  normal  0.0447884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1976  UbiA prenyltransferase  27.81 
 
 		 344 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000257247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2883  UbiA prenyltransferase  25.66 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  31.73 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  31.9 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  30.83 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>