114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2883 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2883  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
289 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0160  UbiA prenyltransferase  52.58 
 
 
291 aa  296  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000799272  hitchhiker  0.000000000000598028 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0429  UbiA prenyltransferase  52.05 
 
 
292 aa  287  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.910101 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7263  UbiA prenyltransferase  50.52 
 
 
300 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000688363  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2286  UbiA prenyltransferase  47.97 
 
 
309 aa  198  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.3473 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2631  UbiA prenyltransferase  34.43 
 
 
302 aa  97.1  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0780  UbiA prenyltransferase  32.21 
 
 
336 aa  93.6  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11100  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  28.91 
 
 
287 aa  89.7  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.197382 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  31.43 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  32.1 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0986  UbiA prenyltransferase  32.39 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.665477  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  34.62 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1557  UbiA prenyltransferase  30.17 
 
 
284 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0977  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  29.66 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.92785  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  27.72 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  34.02 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  28.73 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  31.44 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  30.34 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  24.7 
 
 
278 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  28.08 
 
 
278 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1089  UbiA prenyltransferase  28.28 
 
 
313 aa  58.9  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  35.59 
 
 
279 aa  58.9  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3669  UbiA prenyltransferase  30.61 
 
 
185 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000695269  normal  0.0238668 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1824  UbiA prenyltransferase  31.62 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.547794  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1730  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  26.71 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  39.78 
 
 
279 aa  57  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  24 
 
 
283 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20661  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.34 
 
 
336 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1605  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.93 
 
 
325 aa  54.3  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0288  UbiA prenyltransferase  33.1 
 
 
241 aa  55.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.16612  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  35.56 
 
 
280 aa  53.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2426  UbiA prenyltransferase  32.35 
 
 
250 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0771  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  30.43 
 
 
259 aa  53.1  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0487917  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2562  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.5 
 
 
307 aa  52.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04831  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  33 
 
 
315 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04521  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  33 
 
 
315 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0427  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  33 
 
 
315 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2470  UbiA prenyltransferase  27.92 
 
 
289 aa  52.8  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0292823  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1344  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.85 
 
 
316 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.256325  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0545  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  32.22 
 
 
330 aa  52.8  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.659162  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0602  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.11 
 
 
330 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.171113  normal  0.0295962 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0708  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  32.29 
 
 
332 aa  51.6  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.630035  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0941  bacteriochlorophyll c synthase  28.85 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2084  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.28 
 
 
339 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.748804 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  30.11 
 
 
288 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  28.06 
 
 
535 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3714  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.01 
 
 
315 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2325  UbiA prenyltransferase  30.94 
 
 
292 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00527933  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1742  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.11 
 
 
276 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04901  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.9 
 
 
315 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16384  predicted protein  32.29 
 
 
317 aa  50.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.960686  normal  0.418422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0020  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  30.12 
 
 
343 aa  50.4  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0630  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.11 
 
 
330 aa  50.8  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.774634  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12008  Maf-like protein  33.91 
 
 
283 aa  50.8  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3341  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.92 
 
 
337 aa  49.3  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.03622 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2360  bacteriochlorophyll c synthase  33.6 
 
 
333 aa  49.3  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.663632  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04241  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.76 
 
 
316 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0583  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30 
 
 
320 aa  49.3  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0209  bacteriochlorophyll c synthase  32.08 
 
 
334 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0876  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.11 
 
 
326 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1685  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  26.7 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  27.98 
 
 
534 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0897  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.41 
 
 
316 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.841681 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  33.6 
 
 
333 aa  48.1  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3844  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  33.33 
 
 
340 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0940  UbiA prenyltransferase  27.97 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.500041  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4114  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.72 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  29.63 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4380  UbiA prenyltransferase  26.84 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1998  bacteriochlorophyll c synthase  35.63 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0857  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  31.18 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  0.0717039 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0806  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.17 
 
 
317 aa  47.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.196063  hitchhiker  0.00946917 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1849  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.19 
 
 
316 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000654272 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2757  UbiA prenyltransferase  25.23 
 
 
324 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0627  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.63 
 
 
303 aa  46.2  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.92 
 
 
318 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  30.39 
 
 
285 aa  45.8  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1759  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.9 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04811  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.9 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.233119  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4711  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  32.14 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3747  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.48 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0380  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.59 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  25.94 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0824  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  37.5 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129328  normal  0.188314 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0371  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.59 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.156009  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3913  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  23.86 
 
 
318 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2584  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  22.99 
 
 
280 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  28.78 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46085  predicted protein  25.57 
 
 
423 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.232641  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1302  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  53.85 
 
 
303 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1782  UbiA prenyltransferase  22.15 
 
 
247 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3080  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  30.2 
 
 
320 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2246  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  26.73 
 
 
326 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0326669  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3468  protoheme IX farnesyltransferase  29.49 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.27 
 
 
300 aa  43.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3184  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  26.28 
 
 
313 aa  43.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934853  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0363  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  26.34 
 
 
324 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0125  protoheme IX farnesyltransferase  33.73 
 
 
297 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350123  normal  0.0256302 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.09 
 
 
376 aa  43.1  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>