136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1406 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1406  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
318 aa  640    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.151808  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1416  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  92.16 
 
 
320 aa  552  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000808669  hitchhiker  0.00108845 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2690  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  46.72 
 
 
301 aa  258  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0169  UbiA prenyltransferase  44.67 
 
 
319 aa  257  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3242  UbiA prenyltransferase  41.18 
 
 
310 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000441588  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3527  UbiA prenyltransferase  42.55 
 
 
304 aa  246  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4060  UbiA prenyltransferase  40.85 
 
 
327 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000422239  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5061  UbiA prenyltransferase  44.36 
 
 
295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5056  UbiA prenyltransferase  44.36 
 
 
295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.397977  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2248  UbiA prenyltransferase  41.1 
 
 
327 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000928316  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1995  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  43.21 
 
 
301 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3217  UbiA prenyltransferase  39 
 
 
315 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000417906  normal  0.0803548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2194  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  39.73 
 
 
331 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  0.405209 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1966  UbiA prenyltransferase  40.3 
 
 
301 aa  200  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1818  UbiA prenyltransferase  39.18 
 
 
335 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0233  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  38.87 
 
 
291 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1948  UbiA prenyltransferase  37.73 
 
 
290 aa  193  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3231  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  37.07 
 
 
326 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3731  UbiA prenyltransferase  33.1 
 
 
318 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000383911  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0329  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.77 
 
 
294 aa  176  7e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2584  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.69 
 
 
280 aa  175  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4052  UbiA prenyltransferase  32.87 
 
 
296 aa  175  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6246  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  37.59 
 
 
321 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.434954  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1642  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 
280 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1645  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.97 
 
 
296 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1013  UbiA prenyltransferase  33.33 
 
 
291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.810785 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2111  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 
285 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1405  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.04 
 
 
286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.289114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4052  UbiA prenyltransferase  35.16 
 
 
295 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0321079  normal  0.0610101 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1962  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.06 
 
 
284 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1502  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  36.94 
 
 
284 aa  159  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5665  UbiA prenyltransferase  29.11 
 
 
334 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1465  UbiA prenyltransferase  35.11 
 
 
288 aa  147  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0342243  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1773  UbiA prenyltransferase  31.5 
 
 
312 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143657  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0164  UbiA prenyltransferase  31.56 
 
 
306 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01330  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  30.94 
 
 
308 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.139856  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2564  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.22 
 
 
296 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4030  UbiA prenyltransferase  32.38 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0207  UbiA prenyltransferase  30.8 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2376  UbiA prenyltransferase  31.67 
 
 
293 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00872573 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1739  UbiA prenyltransferase  30 
 
 
309 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.463163  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0509  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.13 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5017  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 
310 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5105  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 
310 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5398  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 
310 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3882  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  29.96 
 
 
300 aa  136  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0147542 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03325  hypothetical protein  34.27 
 
 
288 aa  133  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13840  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  28.21 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.409705 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1216  UbiA prenyltransferase  31.18 
 
 
268 aa  130  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3500  UbiA prenyltransferase  32.09 
 
 
303 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0251416  normal  0.998384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1162  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  30.53 
 
 
309 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5647  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.13 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972771  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2460  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  29.32 
 
 
294 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.372558  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0811  UbiA prenyltransferase  28.95 
 
 
308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1026  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  30.54 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1710  hypothetical protein  32.05 
 
 
503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.792915  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0993  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  30.54 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4253  hypothetical protein  28.68 
 
 
477 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.326142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1137  hypothetical protein  31.96 
 
 
483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136806  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0269  UbiA prenyltransferase  27.57 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7178  hypothetical protein  29.37 
 
 
475 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0064  hypothetical protein  28.15 
 
 
489 aa  105  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0803  hypothetical protein  26.62 
 
 
479 aa  102  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0500  hypothetical protein  32 
 
 
472 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19137 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0855  hypothetical protein  26.62 
 
 
479 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719485  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5594  hypothetical protein  27.31 
 
 
494 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1029  hypothetical protein  29.6 
 
 
485 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3635  hypothetical protein  34.74 
 
 
479 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2275  hypothetical protein  33.51 
 
 
473 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.493912 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4211  hypothetical protein  29.1 
 
 
482 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2161  hypothetical protein  28 
 
 
484 aa  95.1  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0898  hypothetical protein  28.52 
 
 
474 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.897817  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2829  hypothetical protein  24.83 
 
 
460 aa  93.2  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0400356  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5788  hypothetical protein  32.95 
 
 
484 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3784  hypothetical protein  29.64 
 
 
474 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3980  hypothetical protein  27.96 
 
 
498 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0272963  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4796  hypothetical protein  25.98 
 
 
631 aa  90.1  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2964  hypothetical protein  27.4 
 
 
479 aa  88.6  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3487  hypothetical protein  27.91 
 
 
508 aa  89  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3163  hypothetical protein  29.21 
 
 
508 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147535  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0757  hypothetical protein  26.73 
 
 
481 aa  82  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0134  UbiA prenyltransferase  33.88 
 
 
180 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00304633  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2303  hypothetical protein  25.61 
 
 
483 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223349  normal  0.0447884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3359  hypothetical protein  29.21 
 
 
521 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0936  hypothetical protein  30.36 
 
 
498 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507653  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0173  hypothetical protein  28.16 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0132  putative transmembrane potein  37.5 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0144788  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1976  UbiA prenyltransferase  25.6 
 
 
344 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000257247 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1811  prenyltransferase  30.06 
 
 
286 aa  60.1  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  29.55 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0179  prenyltransferase  32.98 
 
 
294 aa  53.5  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0154  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  28.78 
 
 
289 aa  52  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.383196  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1429  prenyltransferase  29.79 
 
 
291 aa  50.8  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0160  prenyltransferase  31.91 
 
 
294 aa  50.1  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.579339  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0218  prenyltransferase  32.26 
 
 
289 aa  50.1  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0818  prenyltransferase  33.61 
 
 
289 aa  49.7  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00247672  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2096  prenyltransferase  36.36 
 
 
301 aa  49.7  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.274994  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  34.31 
 
 
280 aa  49.3  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0771  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  37.74 
 
 
259 aa  49.3  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0487917  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  27.84 
 
 
282 aa  48.5  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>