125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0132 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0132  putative transmembrane potein  100 
 
 
124 aa  256  8e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0144788  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1465  UbiA prenyltransferase  43.62 
 
 
288 aa  94  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0342243  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0757  hypothetical protein  40 
 
 
481 aa  90.5  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0233  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  41.74 
 
 
291 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1029  hypothetical protein  48.28 
 
 
485 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5056  UbiA prenyltransferase  42.99 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.397977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5061  UbiA prenyltransferase  42.99 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1013  UbiA prenyltransferase  51.16 
 
 
291 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.810785 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4253  hypothetical protein  44.68 
 
 
477 aa  80.9  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.326142 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3527  UbiA prenyltransferase  38.95 
 
 
304 aa  78.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1818  UbiA prenyltransferase  39.13 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2690  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 
301 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2275  hypothetical protein  46.05 
 
 
473 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.493912 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2161  hypothetical protein  41.35 
 
 
484 aa  76.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3487  hypothetical protein  40.78 
 
 
508 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0855  hypothetical protein  36.27 
 
 
479 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719485  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0169  UbiA prenyltransferase  41.3 
 
 
319 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1645  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  40.57 
 
 
296 aa  75.5  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0803  hypothetical protein  36.27 
 
 
479 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4060  UbiA prenyltransferase  40.38 
 
 
327 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000422239  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3163  hypothetical protein  42.86 
 
 
508 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147535  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2248  UbiA prenyltransferase  38.89 
 
 
327 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000928316  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3217  UbiA prenyltransferase  39.8 
 
 
315 aa  73.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000417906  normal  0.0803548 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0500  hypothetical protein  45.45 
 
 
472 aa  73.9  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.19137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5017  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  40.34 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5105  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  40.34 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27999  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5398  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  40.34 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1405  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  38.6 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.289114 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3980  hypothetical protein  44.3 
 
 
498 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0272963  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5665  UbiA prenyltransferase  41.05 
 
 
334 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0329  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  42.34 
 
 
294 aa  71.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1137  hypothetical protein  36.52 
 
 
483 aa  71.6  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136806  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01330  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  43.59 
 
 
308 aa  71.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.139856  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2964  hypothetical protein  36.59 
 
 
479 aa  70.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0064  hypothetical protein  41.25 
 
 
489 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1710  hypothetical protein  44 
 
 
503 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.792915  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03325  hypothetical protein  38.61 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4052  UbiA prenyltransferase  42.17 
 
 
296 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7178  hypothetical protein  44.16 
 
 
475 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2194  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.83 
 
 
331 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  0.405209 
 
 
-
 
NC_002950  PG0509  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  37.76 
 
 
286 aa  67  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0207  UbiA prenyltransferase  39.6 
 
 
308 aa  67  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3731  UbiA prenyltransferase  39.77 
 
 
318 aa  67  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000383911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1416  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  38.96 
 
 
320 aa  67  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000808669  hitchhiker  0.00108845 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1502  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  37.23 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130276  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1406  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  38.96 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.151808  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5594  hypothetical protein  39.36 
 
 
494 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1773  UbiA prenyltransferase  41.05 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143657  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3635  hypothetical protein  38.96 
 
 
479 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0164  UbiA prenyltransferase  38 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1948  UbiA prenyltransferase  36.36 
 
 
290 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3784  hypothetical protein  43.22 
 
 
474 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3242  UbiA prenyltransferase  38.89 
 
 
310 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000441588  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4796  hypothetical protein  35.83 
 
 
631 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3882  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
300 aa  64.3  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0147542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4211  hypothetical protein  33.04 
 
 
482 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1216  UbiA prenyltransferase  38.81 
 
 
268 aa  63.5  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3231  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  39.19 
 
 
326 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4030  UbiA prenyltransferase  43.59 
 
 
288 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0269  UbiA prenyltransferase  40.48 
 
 
322 aa  62.8  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3500  UbiA prenyltransferase  44.16 
 
 
303 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0251416  normal  0.998384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3359  hypothetical protein  45.12 
 
 
521 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1962  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  28.93 
 
 
284 aa  62  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2111  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  37.21 
 
 
285 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5788  hypothetical protein  42.31 
 
 
484 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0898  hypothetical protein  41.12 
 
 
474 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.897817  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4052  UbiA prenyltransferase  32.56 
 
 
295 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0321079  normal  0.0610101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2376  UbiA prenyltransferase  41.18 
 
 
293 aa  61.6  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00872573 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2584  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  30.65 
 
 
280 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0936  hypothetical protein  45.83 
 
 
498 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507653  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6246  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  37.08 
 
 
321 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.434954  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1995  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  40.3 
 
 
301 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2829  hypothetical protein  33.65 
 
 
460 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0400356  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13840  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.37 
 
 
302 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.409705 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1642  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 
280 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1966  UbiA prenyltransferase  46.91 
 
 
301 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5647  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  41.1 
 
 
309 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972771  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2460  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 
294 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.372558  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0811  UbiA prenyltransferase  33.67 
 
 
308 aa  54.7  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1162  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  39.73 
 
 
309 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0173  hypothetical protein  39.64 
 
 
474 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1026  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
281 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  30 
 
 
277 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0993  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  44.62 
 
 
281 aa  51.6  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1739  UbiA prenyltransferase  35.37 
 
 
309 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.463163  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  46.77 
 
 
318 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2564  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  42.25 
 
 
296 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  40 
 
 
282 aa  47.8  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2303  hypothetical protein  41.25 
 
 
483 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223349  normal  0.0447884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  39.71 
 
 
293 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  37.66 
 
 
312 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3815  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  40.62 
 
 
287 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0380  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  41.18 
 
 
290 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0371  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  41.18 
 
 
290 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.156009  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0245  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.06 
 
 
287 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0729  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.06 
 
 
287 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.262552  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0697  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.06 
 
 
287 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370156  normal  0.206083 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1786  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  36.99 
 
 
287 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2657  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  39.06 
 
 
287 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0502298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3468  protoheme IX farnesyltransferase  31.82 
 
 
297 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>