92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1710 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1710  hypothetical protein  100 
 
 		 503 aa  1025    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.792915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0064  hypothetical protein  60.95 
 
 		 489 aa  543  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0500  hypothetical protein  49.66 
 
 		 472 aa  426  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.19137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0898  hypothetical protein  49.44 
 
 		 474 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.897817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3784  hypothetical protein  48.78 
 
 		 474 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0173  hypothetical protein  50.45 
 
 		 474 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3980  hypothetical protein  47.86 
 
 		 498 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2275  hypothetical protein  46.43 
 
 		 473 aa  362  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2303  hypothetical protein  47.33 
 
 		 483 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223349  normal  0.0447884 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1137  hypothetical protein  43.39 
 
 		 483 aa  356  6.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1029  hypothetical protein  44.01 
 
 		 485 aa  353  5.9999999999999994e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2161  hypothetical protein  42.66 
 
 		 484 aa  343  4e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0855  hypothetical protein  41.59 
 
 		 479 aa  340  4e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.719485  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0803  hypothetical protein  41.59 
 
 		 479 aa  340  5e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2829  hypothetical protein  43.33 
 
 		 460 aa  339  9e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0400356  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4253  hypothetical protein  43.47 
 
 		 477 aa  334  3e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.326142 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2964  hypothetical protein  40.68 
 
 		 479 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3635  hypothetical protein  42.01 
 
 		 479 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5788  hypothetical protein  40.57 
 
 		 484 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4211  hypothetical protein  37.34 
 
 		 482 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0757  hypothetical protein  40.88 
 
 		 481 aa  299  8e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7178  hypothetical protein  38.69 
 
 		 475 aa  283  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5594  hypothetical protein  37.86 
 
 		 494 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3163  hypothetical protein  40.99 
 
 		 508 aa  281  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3487  hypothetical protein  41.44 
 
 		 508 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3359  hypothetical protein  40.99 
 
 		 521 aa  268  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4796  hypothetical protein  35.79 
 
 		 631 aa  264  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0936  hypothetical protein  35.31 
 
 		 498 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507653  normal  0.623034 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1405  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.83 
 
 		 286 aa  124  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.289114 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0233  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1948  UbiA prenyltransferase  35.97 
 
 		 290 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0207  UbiA prenyltransferase  40.51 
 
 		 308 aa  117  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1416  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.34 
 
 		 320 aa  115  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000808669  hitchhiker  0.00108845 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1406  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.05 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.151808  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2690  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  29.82 
 
 		 301 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000203093  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01330  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  38.51 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.139856  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0164  UbiA prenyltransferase  38.27 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4052  UbiA prenyltransferase  35 
 
 		 295 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0321079  normal  0.0610101 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0169  UbiA prenyltransferase  33.58 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3527  UbiA prenyltransferase  39.18 
 
 		 304 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2194  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.33 
 
 		 331 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  0.405209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3242  UbiA prenyltransferase  32.92 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000441588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5665  UbiA prenyltransferase  30.56 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1013  UbiA prenyltransferase  32.97 
 
 		 291 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.810785 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1818  UbiA prenyltransferase  30.13 
 
 		 335 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3731  UbiA prenyltransferase  32.62 
 
 		 318 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000383911  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0329  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.38 
 
 		 294 aa  104  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1642  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  30.8 
 
 		 280 aa  104  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1645  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.44 
 
 		 296 aa  103  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1502  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.9 
 
 		 284 aa  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130276  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3500  UbiA prenyltransferase  34.39 
 
 		 303 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0251416  normal  0.998384 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5647  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 309 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0972771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4030  UbiA prenyltransferase  35.02 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1995  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  32.98 
 
 		 301 aa  100  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3882  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.32 
 
 		 300 aa  100  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0147542 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13840  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  36.76 
 
 		 302 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.409705 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4052  UbiA prenyltransferase  31.91 
 
 		 296 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.820743 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1465  UbiA prenyltransferase  33.52 
 
 		 288 aa  97.8  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0342243  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2111  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  38.25 
 
 		 285 aa  97.8  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5398  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 		 310 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5105  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 		 310 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5017  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 		 310 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0811  UbiA prenyltransferase  36.72 
 
 		 308 aa  97.1  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3217  UbiA prenyltransferase  31.51 
 
 		 315 aa  96.7  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000417906  normal  0.0803548 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4060  UbiA prenyltransferase  30.17 
 
 		 327 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000422239  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1162  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  37.57 
 
 		 309 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278608  normal  0.450588 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1962  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  35.03 
 
 		 284 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2248  UbiA prenyltransferase  31.06 
 
 		 327 aa  94.7  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000928316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2584  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 280 aa  92.8  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3231  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  33.59 
 
 		 326 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1966  UbiA prenyltransferase  32.4 
 
 		 301 aa  91.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5056  UbiA prenyltransferase  30.34 
 
 		 295 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.397977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5061  UbiA prenyltransferase  30.34 
 
 		 295 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0509  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 286 aa  91.3  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03325  hypothetical protein  32.51 
 
 		 288 aa  90.1  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1216  UbiA prenyltransferase  34.1 
 
 		 268 aa  90.1  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6246  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  38.29 
 
 		 321 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.434954  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1026  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  30.93 
 
 		 281 aa  87.4  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0993  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  30.93 
 
 		 281 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2460  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.372558  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1773  UbiA prenyltransferase  34.07 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0269  UbiA prenyltransferase  35.64 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1739  UbiA prenyltransferase  36.42 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.463163  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2564  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  37.06 
 
 		 296 aa  69.7  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0132  putative transmembrane potein  44 
 
 		 124 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0144788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2376  UbiA prenyltransferase  40.11 
 
 		 293 aa  69.3  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00872573 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  29.29 
 
 		 283 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  29.69 
 
 		 288 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2416  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  31.25 
 
 		 219 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  27.19 
 
 		 839 aa  45.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1964  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  26.92 
 
 		 310 aa  43.9  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.855973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1733  UbiA prenyltransferase  28.39 
 
 		 276 aa  43.9  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>