67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1733 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1733  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
276 aa  535  1e-151  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0740  UbiA prenyltransferase  68.36 
 
 
275 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0749  UbiA prenyltransferase  77.9 
 
 
276 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.870578  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0555  UbiA prenyltransferase  65.33 
 
 
290 aa  326  3e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0958  UbiA prenyltransferase  36.81 
 
 
294 aa  167  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  40.82 
 
 
277 aa  144  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  35.54 
 
 
288 aa  99.4  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  33.85 
 
 
284 aa  94  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  30 
 
 
279 aa  94  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  34.16 
 
 
282 aa  92  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  31.67 
 
 
279 aa  90.1  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  26.91 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1730  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  27.84 
 
 
278 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  34.03 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  30.81 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  31.09 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  27.09 
 
 
278 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  34.03 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  32.14 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  35.58 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  31.61 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0977  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  30.71 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.92785  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  31.98 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1016  UbiA prenyltransferase  35.21 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3311  prenyltransferase  32 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  28.21 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3485  UbiA prenyltransferase  25.25 
 
 
291 aa  62.4  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12008  Maf-like protein  30.64 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2954  prenyltransferase  27.23 
 
 
308 aa  59.7  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04595  hypothetical protein  26.21 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.311519  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  27.46 
 
 
280 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1449  UbiA prenyltransferase  30.99 
 
 
284 aa  57  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.260951  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0771  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  25.53 
 
 
259 aa  55.8  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0487917  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0306  UbiA prenyltransferase  23.35 
 
 
288 aa  55.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2079  prenyltransferase  32.39 
 
 
287 aa  53.9  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.728738  normal  0.183793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2480  prenyltransferase  28.65 
 
 
293 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0220727  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1782  UbiA prenyltransferase  26.63 
 
 
247 aa  53.5  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0012  tocopherol phytyltransferase  28.66 
 
 
318 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0010  tocopherol phytyltransferase  28.66 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2757  UbiA prenyltransferase  27.96 
 
 
324 aa  49.7  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0427  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.93 
 
 
315 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3669  UbiA prenyltransferase  32.08 
 
 
185 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000695269  normal  0.0238668 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1385  UbiA prenyltransferase  21.26 
 
 
318 aa  48.9  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0949152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04521  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.31 
 
 
315 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04831  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.31 
 
 
315 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.652512  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0002  tocopherol phytyltransferase  22.03 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2123  UbiA prenyltransferase  31.13 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.905572 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03228  conserved hypothetical protein  33.5 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04901  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.93 
 
 
315 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3881  tocopherol phytyltransferase  26.53 
 
 
349 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.630797  decreased coverage  0.00732369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0876  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.37 
 
 
326 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3472  tocopherol phytyltransferase  25.66 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00788485  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32069  predicted protein  21.46 
 
 
319 aa  43.5  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1710  hypothetical protein  28.39 
 
 
503 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.792915  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1958  prenyltransferase  26.4 
 
 
313 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1786  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  24.68 
 
 
287 aa  43.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1159  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  29.61 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0126  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  25.52 
 
 
287 aa  43.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1101  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  23.5 
 
 
302 aa  42.7  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5594  hypothetical protein  28.66 
 
 
494 aa  42.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.626136  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.79 
 
 
299 aa  42.7  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3527  UbiA prenyltransferase  33.66 
 
 
304 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.26 
 
 
303 aa  42.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4142  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.63 
 
 
293 aa  42.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.356002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1145  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  32.14 
 
 
333 aa  42.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1962  phosphoribose diphosphate:decaprenyl-phosphate phosphoribosyltransferase  31.52 
 
 
284 aa  42.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.32 
 
 
286 aa  42.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.442555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>