61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0958 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0958  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
294 aa  571  1.0000000000000001e-162  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0740  UbiA prenyltransferase  39.78 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1733  UbiA prenyltransferase  36.81 
 
 
276 aa  167  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0555  UbiA prenyltransferase  38.11 
 
 
290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0749  UbiA prenyltransferase  38.77 
 
 
276 aa  142  5e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.870578  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  30.45 
 
 
277 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  29.73 
 
 
283 aa  93.2  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  27.73 
 
 
288 aa  85.9  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  29.26 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  35.39 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  32.66 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  24.52 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3669  UbiA prenyltransferase  32.08 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000695269  normal  0.0238668 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  29.89 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0771  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  28.02 
 
 
259 aa  65.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0487917  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1016  UbiA prenyltransferase  29.68 
 
 
284 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  28.02 
 
 
283 aa  63.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  29.86 
 
 
285 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  29.7 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  26.54 
 
 
279 aa  59.7  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  30.07 
 
 
282 aa  59.7  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  28.38 
 
 
281 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1730  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  26.05 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3311  prenyltransferase  29.76 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  28.71 
 
 
278 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1449  UbiA prenyltransferase  31.45 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.260951  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  26.32 
 
 
280 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12008  Maf-like protein  27.43 
 
 
283 aa  53.5  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0977  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  27.45 
 
 
278 aa  53.1  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.92785  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  24.69 
 
 
289 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  30 
 
 
279 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3992  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.56 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0940  UbiA prenyltransferase  25.11 
 
 
313 aa  50.4  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.500041  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1385  UbiA prenyltransferase  23.39 
 
 
318 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0949152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2015  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  25.48 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.9 
 
 
303 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5287  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.25 
 
 
295 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111529  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2079  prenyltransferase  23.15 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.728738  normal  0.183793 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2227  bacteriochlorophyll c synthase  24.83 
 
 
335 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1337  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  24.17 
 
 
286 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3530  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.74 
 
 
301 aa  45.8  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.47035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2954  prenyltransferase  29.14 
 
 
308 aa  45.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.74 
 
 
274 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04595  hypothetical protein  23.49 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.311519  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.18 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1155  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  21.63 
 
 
376 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.142622  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1719  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.15 
 
 
297 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.641378  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1958  prenyltransferase  25.57 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.24 
 
 
300 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0002  tocopherol phytyltransferase  25.71 
 
 
299 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1105  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.39 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.359039  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1782  UbiA prenyltransferase  22.99 
 
 
247 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2895  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  26.54 
 
 
285 aa  43.5  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1302  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.15 
 
 
303 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3485  UbiA prenyltransferase  26.32 
 
 
291 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  25.93 
 
 
333 aa  42.7  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2658  UbiA prenyltransferase  24.38 
 
 
302 aa  42.7  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0209  bacteriochlorophyll c synthase  25.48 
 
 
334 aa  42.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2330  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  26.97 
 
 
295 aa  42.4  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45125  predicted protein  29.7 
 
 
502 aa  42.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1145  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25 
 
 
333 aa  42.4  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>