53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04595 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_04595  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  590  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.311519  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1385  UbiA prenyltransferase  54.72 
 
 
318 aa  335  5e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0949152  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0306  UbiA prenyltransferase  52.63 
 
 
288 aa  312  3.9999999999999997e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3485  UbiA prenyltransferase  28.41 
 
 
291 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2480  prenyltransferase  26.37 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0220727  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3311  prenyltransferase  28.06 
 
 
291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1958  prenyltransferase  28.45 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2954  prenyltransferase  27.65 
 
 
308 aa  90.1  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12008  Maf-like protein  27.44 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  30.36 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  29.09 
 
 
281 aa  67  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  29.25 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  28.57 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  27.51 
 
 
283 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0771  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  30.46 
 
 
259 aa  65.1  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0487917  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  27.5 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  28 
 
 
279 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  29.38 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1733  UbiA prenyltransferase  26.21 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4380  UbiA prenyltransferase  24.34 
 
 
327 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  24.02 
 
 
288 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  27.04 
 
 
282 aa  56.2  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  27.23 
 
 
278 aa  56.2  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  26.4 
 
 
278 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  28.87 
 
 
277 aa  55.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  26.17 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  24 
 
 
283 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1338  prenyltransferase  21.32 
 
 
285 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0940  UbiA prenyltransferase  24.79 
 
 
313 aa  52.8  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.500041  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1302  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  21.13 
 
 
303 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  27.17 
 
 
289 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1016  UbiA prenyltransferase  28.28 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1449  UbiA prenyltransferase  23.81 
 
 
284 aa  49.7  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.260951  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1730  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  26.99 
 
 
278 aa  49.3  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  27.66 
 
 
281 aa  49.3  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0977  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  23.68 
 
 
278 aa  48.1  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.92785  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2079  prenyltransferase  27.66 
 
 
287 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.728738  normal  0.183793 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1719  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  18.85 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.641378  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3992  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  19.69 
 
 
306 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0020  bacteriochlorophyll/chlorophyll synthetase  25.97 
 
 
343 aa  47  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0279  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.59 
 
 
302 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0728517  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0958  UbiA prenyltransferase  23.49 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1236  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.86 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1922  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.08 
 
 
302 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1981  prenyltransferase  25.75 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.650334  normal  0.466144 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0340  prenyltransferase  23.44 
 
 
312 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1016  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.16 
 
 
302 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2084  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  24.73 
 
 
339 aa  43.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.748804 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0911  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  23.6 
 
 
300 aa  43.5  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0555  UbiA prenyltransferase  25.24 
 
 
290 aa  43.1  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2123  UbiA prenyltransferase  23.96 
 
 
294 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.905572 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0876  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  26.4 
 
 
326 aa  42.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2061  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  25.43 
 
 
309 aa  42.4  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>