34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1385 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1385  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 318 aa  632  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0949152  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04595  hypothetical protein  54.72 
 
 		 303 aa  335  5e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.311519  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0306  UbiA prenyltransferase  49.49 
 
 		 288 aa  277  2e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3485  UbiA prenyltransferase  24.58 
 
 		 291 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3311  prenyltransferase  27.65 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2480  prenyltransferase  24.11 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0220727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1958  prenyltransferase  29.26 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2954  prenyltransferase  26.22 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12008  Maf-like protein  27.69 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.528538  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  26.13 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  26.09 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2544  prenyltransferase  25.7 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3192  UbiA prenyltransferase  25.97 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.726332  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0625  prenyltransferase  23.79 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.24131  normal  0.221507 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1843  prenyltransferase  27.1 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.183334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1697  prenyltransferase  23.42 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1863  prenyltransferase  24.23 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.959148  normal  0.340007 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1449  UbiA prenyltransferase  27.16 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.260951  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1679  prenyltransferase  24.51 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.558367  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0795  prenyltransferase  26.63 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.686663  hitchhiker  0.00000276603 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0771  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  25.28 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0487917  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1016  UbiA prenyltransferase  24.53 
 
 		 284 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1647  Geranylgeranylglycerol-phosphate geranylgeranyltransferase  25 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.114853  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1040  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  24.66 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0950  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  23.98 
 
 		 278 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  21.34 
 
 		 288 aa  49.7  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0995  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  27.27 
 
 		 278 aa  49.3  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0176059  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0958  UbiA prenyltransferase  23.39 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1733  UbiA prenyltransferase  21.26 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2079  prenyltransferase  26.09 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.728738  normal  0.183793 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  21.05 
 
 		 277 aa  47  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0315  prenyltransferase  21.83 
 
 		 283 aa  45.8  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0977  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  24.7 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.92785  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1730  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  24.43 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>